72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0859 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0859  Hrp conserved HRCS transmembrane protein  100 
 
 		 86 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0274249  hitchhiker  0.00877367 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  56.79 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  56.79 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  56.79 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  56.79 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  56.79 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  56.79 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  56.79 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  56.79 
 
 		 87 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  54.32 
 
 		 87 aa  93.2  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  58.54 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  58.54 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  58.54 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  54.65 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  53.25 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03407  HrcS  60.61 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  41.89 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  44.12 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  36.99 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  37.18 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  37.04 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  37.18 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  37.18 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.29 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  37.65 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  37.65 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  37.65 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  37.65 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  37.65 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  37.65 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  37.35 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.89 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  35.06 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.86 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  28.21 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.07 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  29.27 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.25 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  29.27 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  29.27 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  29.27 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  30 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  41.77 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.43 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.27 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.4 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.71 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.5 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.82 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  30 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.56 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.49 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.07 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.24 
 
 		 89 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  29.49 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  29.49 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  29.49 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  29.49 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  29.49 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0067  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.56 
 
 		 91 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.43 
 
 		 88 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.43 
 
 		 88 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.62 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  28.4 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  28.4 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  28.57 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  27.5 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  29.63 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.31 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.58 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.62 
 
 		 87 aa  40  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>