39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03407 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03407  HrcS  100 
 
 		 67 aa  123  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240869  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0859  Hrp conserved HRCS transmembrane protein  60.32 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0274249  hitchhiker  0.00877367 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  55.22 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  56.06 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  53.73 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  53.73 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  53.73 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  53.73 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  53.73 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  53.73 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  53.73 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  53.97 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  46.27 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  51.52 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  51.52 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  51.52 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  34.92 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  34.92 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  34.92 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.81 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.76 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  42.11 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.07 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  35.48 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  36.84 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  31.15 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.25 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  37.04 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  34.48 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.92 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  39.06 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  33.33 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.6 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  38.89 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.15 
 
 		 89 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>