113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0188 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  69.14 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  69.14 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  69.14 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  69.14 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  69.14 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  63.29 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  63.29 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  63.29 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  63.29 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  56.52 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  53.62 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1535  type III secretion system protein BsaX  53.16 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164439  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  53.16 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0837  type III secretion system protein BsaX  53.16 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2069  type III secretion system protein BsaX  53.16 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2166  HrpO family type III secretion protein  53.16 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  53.16 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0749  type III secretion system protein BsaX  53.16 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.685572  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  43.21 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  41.89 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  39.24 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  40.54 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  40.91 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  46.15 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  35.9 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  44.62 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  44.62 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  36.71 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  39.13 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  44.62 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  44.62 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  44.62 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  31.65 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  31.65 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  31.65 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  31.65 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  31.65 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  31.65 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  37.04 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  33.33 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  30.77 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  33.33 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  33.33 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  44.07 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.19 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  43.9 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  44.07 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  44.07 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  37.18 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  35.8 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  41.25 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.93 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.93 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  29.49 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1751  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  29.49 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.1 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1207  type III secretion protein HrcS  37.97 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.427882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  43.33 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.28 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  39.47 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.39 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0859  Hrp conserved HRCS transmembrane protein  38.6 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0274249  hitchhiker  0.00877367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.59 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0111  export protein FliQ  36.99 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  28 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.53 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.53 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.04 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.34 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  34.88 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.33 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.33 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  35.21 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.09 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.67 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.94 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.86 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.56 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.43 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.14 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0702  type III secretion protein HrpO  34.57 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0211533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.65 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.17 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.56 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.38 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1975  HrpO family type III secretion protein  45.24 
 
 		 89 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 		 88 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.43 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  38 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0787  flagellar biosynthetic protein FliQ  44 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000782848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.43 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2279  HrpO family type III secretion protein  45.24 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0217688  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.67 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>