287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2330 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  100 
 
 
90 aa  178  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  60 
 
 
90 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.56 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  56.82 
 
 
89 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  56.18 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  56.18 
 
 
91 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.56 
 
 
91 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.14 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.33 
 
 
91 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.59 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.68 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.73 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.35 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  41.57 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.33 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.83 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0067  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.11 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.67 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.86 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.47 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0787  flagellar biosynthetic protein FliQ  54.24 
 
 
89 aa  67  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000782848  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.23 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  40 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.35 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.02 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.78 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.8 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0619  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1751  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.05 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.53 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.82 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.05 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  40.74 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.88 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  43.24 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  37.5 
 
 
89 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.33 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3441  export protein FliQ family 3  42.25 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.9 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.02 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  37.97 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1165  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.28 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.68 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.59 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.46 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>