260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3813 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 93 aa  179  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 93 aa  179  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 97 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2279  HrpO family type III secretion protein  68.24 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0217688  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1975  HrpO family type III secretion protein  68.24 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  50.6 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  49.41 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  51.35 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  47.67 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  48.65 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  44.87 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  43.59 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  47.67 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.67 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  50 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.33 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  50 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  39.74 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.77 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  41.98 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.46 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  36.71 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.25 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  39.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  39.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  39.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  39.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  39.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  48.1 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  39.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  40.85 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  38.37 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  43.08 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  43.24 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.02 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  43.24 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  43.24 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  43.24 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.24 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.57 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  43.24 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.73 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.72 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.37 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.66 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  33.7 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.05 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  40.54 
 
 		 87 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  40.79 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.97 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  40.54 
 
 		 87 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  40.54 
 
 		 87 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.86 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  39.44 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  39.44 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  39.44 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.57 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  39.44 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.47 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.89 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.19 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.4 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.8 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.98 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.94 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1207  type III secretion protein HrcS  51.47 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.427882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.1 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.94 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.52 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.86 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.86 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  36.67 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.8 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  43.21 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  36.67 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.25 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  36.67 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.73 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.04 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  36.67 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  36.67 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.37 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  37.97 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.03 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.12 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.15 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.89 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  37.29 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.73 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.84 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.03 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.03 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>