152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3183 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  68.6 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  68.6 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  68.6 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  68.6 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  68.6 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  63.29 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1535  type III secretion system protein BsaX  55.56 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164439  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  55.56 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0837  type III secretion system protein BsaX  55.56 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2069  type III secretion system protein BsaX  55.56 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2166  HrpO family type III secretion protein  55.56 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  55.56 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0749  type III secretion system protein BsaX  55.56 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.685572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  53.62 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  53.62 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  46.58 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  47.95 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  46.58 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  38.1 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  36 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  37.33 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  44.05 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  39.76 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  38.03 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.04 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.04 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  37.88 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.18 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.98 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.47 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  39.73 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.64 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  45.16 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1207  type III secretion protein HrcS  38.67 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.427882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  29.63 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.65 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  28.05 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  32.94 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  28.05 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  28.05 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  32.94 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  28.05 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  32.94 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  28.05 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  28.05 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.59 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  40 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  40 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  33.33 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  36.51 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  36.51 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.84 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.77 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.62 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.72 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.3 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.18 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.78 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.81 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.85 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.77 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.81 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.24 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.34 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  42.86 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.76 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  38.46 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.81 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.99 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  42.86 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  42.86 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.75 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  32.1 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.11 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.65 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.57 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.88 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  28.4 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  28.4 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.72 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.72 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.72 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.75 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.75 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.53 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  38 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.38 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0111  export protein FliQ  35.62 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>