170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3250 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 		 88 aa  170  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  69.77 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  69.77 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  69.77 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  70.59 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  64.71 
 
 		 88 aa  116  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2962  export protein FliQ  59.3 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.29 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.74 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3441  export protein FliQ family 3  50 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  45 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0064  flagellar protein FliQ  42.86 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.42 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1652  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212217  normal  0.924437 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.21 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  39.71 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.16 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.59 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.24 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.74 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.91 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.45 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.1 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.18 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.84 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.79 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.26 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.19 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  50 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.66 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.46 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.84 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.8 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.84 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.46 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.04 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.53 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.77 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.43 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  38.16 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.51 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.48 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.53 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.62 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.9 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.62 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.04 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.62 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.88 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.9 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.21 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  40.3 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  48.15 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.3 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.85 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.84 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.53 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.19 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.77 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.9 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.55 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.13 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.68 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.96 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.96 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.96 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.06 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3551  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.84 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.89 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  37.66 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.68 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.58 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.59 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.53 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.66 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.88 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.3 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.03 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  48.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5494  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.78 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.73 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.88 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.62 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.66 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.73 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.62 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  36.62 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.26 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.62 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.58 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>