143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2962 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2962  export protein FliQ  100 
 
 		 92 aa  175  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  59.77 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.3 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  56.32 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  56.32 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  54.02 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  53.41 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.89 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.26 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.59 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.85 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.53 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3441  export protein FliQ family 3  40.79 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.54 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  50 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  40.85 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.48 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.33 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.48 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.15 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.15 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.55 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.58 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.58 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.58 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.85 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  52 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.97 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  44.23 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.78 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.62 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.97 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.16 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.21 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.63 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.84 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  57.14 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.96 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.59 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  46 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.08 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.59 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  37.88 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.13 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.21 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  44 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  42 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.57 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.33 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.11 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.92 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.11 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.94 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.67 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.92 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.83 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.44 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.83 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.14 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.93 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.93 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.06 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.57 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.24 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  42 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.49 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.49 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.55 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  44 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.88 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.92 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0203  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.13 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.94 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.38 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.71 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0064  flagellar protein FliQ  43.64 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.71 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.97 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.59 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.64 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1652  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.64 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212217  normal  0.924437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  37.93 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.3 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  54.29 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  42.31 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.46 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.5 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  32.73 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  37.88 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.35 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.62 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.82 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>