164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2603 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  100 
 
 
88 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  88.51 
 
 
88 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  88.51 
 
 
88 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  67.05 
 
 
88 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  69.77 
 
 
88 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  55.17 
 
 
88 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2962  export protein FliQ  54.02 
 
 
92 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.73 
 
 
88 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.68 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.59 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.91 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.13 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.32 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.32 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.48 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  49.15 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.11 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.79 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0064  flagellar protein FliQ  47.14 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.47 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.14 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000893179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.47 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1652  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.14 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212217  normal  0.924437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.46 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.97 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.93 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3551  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  57.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3774  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023221  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.97 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  41.67 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.74 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1696  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.91 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3441  export protein FliQ family 3  43.66 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.93 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.3 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5494  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.05 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  40.79 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.77 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.13 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.77 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4408  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359826  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.8 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.77 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1520  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.74 
 
 
87 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00598342  normal  0.364566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.44 
 
 
89 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.94 
 
 
89 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.51 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.08 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  39.24 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.47 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.08 
 
 
89 aa  50.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.11 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.84 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  51.85 
 
 
90 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  45 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0041  export protein FliQ  50 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.33 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.98 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.33 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.94 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.71 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.71 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.71 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.19 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.03 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.13 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.74 
 
 
89 aa  47.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  37.5 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.6 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  28.89 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.6 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.03 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.06 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>