166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0122 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.76 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.38 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.51 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4408  flagellar biosynthesis protein FliQ  58.33 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5494  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.95 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178989  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1520  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.76 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00598342  normal  0.364566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1696  flagellar biosynthesis protein FliQ  58.33 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3774  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.14 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023221  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.19 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.19 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.56 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.7 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.3 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.3 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.71 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.71 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.97 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.48 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  41.67 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.67 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.66 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  41.67 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.77 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.86 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.43 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.38 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.66 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.14 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.14 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.14 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  40.26 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.9 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.65 
 
 
89 aa  53.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.46 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.08 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.43 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.43 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3551  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.9 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.31 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.27 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.52 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.59 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.03 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.48 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.31 
 
 
89 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.03 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.44 
 
 
88 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  38.67 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.14 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.67 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.97 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.24 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.28 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  38.89 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.57 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.44 
 
 
88 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.27 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  33.77 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.66 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  46 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.62 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.75 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  38.03 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.19 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.06 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.06 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.19 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  38.46 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  36.47 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  43.94 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.98 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  35 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  35 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.91 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  36.23 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  44 
 
 
88 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.56 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.62 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.18 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.8 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  34.78 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  35.38 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  38.98 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.62 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  36 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.81 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>