257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5494 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5494  flagellar biosynthesis protein FliQ  100 
 
 
87 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178989  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  88.51 
 
 
87 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  86.21 
 
 
87 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1520  flagellar biosynthesis protein FliQ  91.95 
 
 
87 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00598342  normal  0.364566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4408  flagellar biosynthesis protein FliQ  89.66 
 
 
87 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3774  flagellar biosynthesis protein FliQ  80.46 
 
 
87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023221  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1696  flagellar biosynthesis protein FliQ  81.61 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  60.92 
 
 
88 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  60.92 
 
 
88 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.62 
 
 
88 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1382  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.3 
 
 
87 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.17 
 
 
87 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1932  flagellar biosynthesis protein FliQ  60.71 
 
 
87 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.618513  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2635  flagellar biosynthetic protein FliQ  61.04 
 
 
88 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2828  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.74 
 
 
88 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.224075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2605  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.74 
 
 
88 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459471  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0122  flagellar biosynthetic protein fliQ  55.95 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.7 
 
 
84 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.13 
 
 
88 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3551  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.13 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.98 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.98 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.98 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.38 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.13 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.53 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.38 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.23 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.43 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.38 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.25 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.87 
 
 
83 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.42 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2113  export protein FliQ  48.57 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4195  export protein FliQ  43.21 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.93 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.48 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2603  export protein FliQ  42.05 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.627445  hitchhiker  0.000444026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.5 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.53 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.12 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.12 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.58 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.65 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.03 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.9 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.45 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.97 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  43.53 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.83 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  46.97 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.88 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  50 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  36.9 
 
 
91 aa  62  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3250  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.78 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.05 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.53 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.53 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.21 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.77 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.28 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  46.38 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.04 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.9 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.73 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.79 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.84 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.84 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.52 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.52 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.77 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.54 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1165  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3441  export protein FliQ family 3  42.03 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.84 
 
 
89 aa  57  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.93 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.73 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  51.79 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.4 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.24 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>