More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1669 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 525 aa  1061    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  92.76 
 
 		 525 aa  999    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.81 
 
 		 526 aa  825    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.23 
 
 		 515 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  45.31 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  44.55 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  41.29 
 
 		 588 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  41.11 
 
 		 528 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.15 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  42.86 
 
 		 526 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  42.97 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  40 
 
 		 518 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  40.08 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  40.08 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  41.02 
 
 		 543 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  39.92 
 
 		 542 aa  360  4e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  36.21 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  35.24 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.99 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 		 518 aa  259  8e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  27.76 
 
 		 532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  22.6 
 
 		 557 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.4 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  23.32 
 
 		 545 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.28 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.98 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  22.27 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30.74 
 
 		 466 aa  93.6  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  33.62 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  25.78 
 
 		 499 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  30.3 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.3 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  30.3 
 
 		 470 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  30.3 
 
 		 470 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  29.87 
 
 		 470 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.87 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.87 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  24.7 
 
 		 466 aa  87.8  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.96 
 
 		 470 aa  87  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.87 
 
 		 470 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  30.8 
 
 		 479 aa  87  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.87 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.87 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  30.57 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  24.75 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.96 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  28.46 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  29.86 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.42 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  29.79 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.58 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  28.63 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.62 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.26 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  33.02 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  26.39 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  30.09 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.65 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.62 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  30.98 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.23 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  29.87 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  29.67 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  23.78 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  24.37 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  27.89 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.98 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.89 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  23.04 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.62 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  24.53 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.89 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.89 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.89 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  23.79 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.89 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.89 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  24.85 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.22 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.98 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  24.56 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.11 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  23.83 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  24.21 
 
 		 497 aa  76.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  22.94 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.11 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.79 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  24.58 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  23.52 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.6 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2767  FAD linked oxidase-like  27.6 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.05 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.12 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>