More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1492 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  100 
 
 
519 aa  1073    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.49 
 
 
515 aa  557  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  42.16 
 
 
526 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  44.55 
 
 
525 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  45.45 
 
 
525 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  42.47 
 
 
516 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.08 
 
 
526 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  40.67 
 
 
514 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  39.61 
 
 
518 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.41 
 
 
517 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  38.51 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  38.7 
 
 
531 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  39.53 
 
 
543 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  40.04 
 
 
542 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  36.38 
 
 
528 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  34.29 
 
 
588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  35.44 
 
 
520 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  35.38 
 
 
518 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.1 
 
 
488 aa  277  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 
518 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  30.34 
 
 
408 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  23.36 
 
 
532 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  22.98 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  23.41 
 
 
545 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  22.91 
 
 
550 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  22.27 
 
 
557 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 
260 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  29.17 
 
 
466 aa  94.4  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  23.23 
 
 
472 aa  87  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.89 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  27.62 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.2 
 
 
461 aa  84  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  29.72 
 
 
481 aa  84  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2767  FAD linked oxidase-like  27.91 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  26.19 
 
 
560 aa  83.6  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  24.46 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.66 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  25.91 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  23.82 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 
482 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.99 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  25.21 
 
 
460 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31583  mitochondrial D-lactate ferricytochrome c oxidoreductase  28.69 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  25.75 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.86 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  24.75 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  23.86 
 
 
453 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.54 
 
 
459 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  26.24 
 
 
470 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.24 
 
 
470 aa  77  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  26.24 
 
 
470 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.24 
 
 
470 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.15 
 
 
457 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.86 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.13 
 
 
460 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.17 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  28.92 
 
 
485 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.19 
 
 
470 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.86 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.17 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.05 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  26.07 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.68 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.04 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  27.47 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.9 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.26 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  28.09 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.9 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  27.66 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.9 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.86 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.41 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.41 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  24.12 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.18 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.47 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.86 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  25.41 
 
 
601 aa  73.6  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.9 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  26.74 
 
 
479 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.47 
 
 
469 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  29.17 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.45 
 
 
464 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  27.4 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.4 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  22.44 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  26.24 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.45 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.87 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.11 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  27.23 
 
 
472 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  26.04 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.8 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>