More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1652 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 543 aa  1117    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  62.83 
 
 		 542 aa  729    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  51.48 
 
 		 514 aa  558  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  49.22 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  49.51 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.06 
 
 		 517 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  47.32 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  46.55 
 
 		 527 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  45.74 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  43.63 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.97 
 
 		 515 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  41.91 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  39.53 
 
 		 519 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  41.47 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.25 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  41.02 
 
 		 525 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  36.47 
 
 		 528 aa  343  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  34.93 
 
 		 588 aa  330  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.78 
 
 		 488 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 		 518 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.59 
 
 		 542 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  46.27 
 
 		 408 aa  180  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  26.25 
 
 		 557 aa  174  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  25.2 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  23.54 
 
 		 545 aa  143  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  35.94 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  26.09 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.25 
 
 		 260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  26.95 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30.74 
 
 		 466 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.4 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  25.22 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.29 
 
 		 459 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.78 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  30.29 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.72 
 
 		 464 aa  97.4  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  32.07 
 
 		 452 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.08 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  26.58 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  25.49 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.94 
 
 		 457 aa  94  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  23.45 
 
 		 472 aa  94  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  29.13 
 
 		 470 aa  94  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.32 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 470 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 470 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  25.37 
 
 		 462 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.53 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 		 459 aa  93.6  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.74 
 
 		 470 aa  93.6  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.74 
 
 		 470 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  24.22 
 
 		 495 aa  93.6  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.74 
 
 		 470 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.74 
 
 		 470 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  30.31 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.25 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.97 
 
 		 460 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  26.38 
 
 		 462 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.51 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  22.55 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.37 
 
 		 468 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  23.26 
 
 		 469 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  24.26 
 
 		 469 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  24.26 
 
 		 469 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  24.15 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  23.91 
 
 		 471 aa  90.9  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 464 aa  90.9  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.95 
 
 		 470 aa  90.5  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  28.88 
 
 		 461 aa  90.5  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  28.46 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 		 462 aa  90.5  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 		 459 aa  90.1  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  24.05 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.05 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  30.24 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.05 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.05 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  33.19 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  24.47 
 
 		 565 aa  88.6  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.43 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  23.31 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  30.17 
 
 		 479 aa  87  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  32.49 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  28.16 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2767  FAD linked oxidase-like  30.71 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.52 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.52 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.22 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  28.99 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0707  FAD linked oxidase domain protein  25.57 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  25.05 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>