More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2767 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2767  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 528 aa  1091    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.74 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.58 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.58 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  31.8 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  30.48 
 
 		 560 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.97 
 
 		 469 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.97 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  29.66 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  30.41 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.97 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  32 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  30.92 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  29.2 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  31.13 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  31.13 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.13 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.1 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.13 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.98 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 457 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  30.12 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  30.74 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  31.13 
 
 		 463 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.14 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.13 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.52 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 		 463 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  29.96 
 
 		 499 aa  98.6  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.57 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.7 
 
 		 474 aa  97.8  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  30.33 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  28.99 
 
 		 495 aa  97.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  29.69 
 
 		 472 aa  97.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  29.34 
 
 		 459 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.13 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.94 
 
 		 459 aa  96.7  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  32.07 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1020  putative glycolate oxidase subunit protein  28.85 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0835602  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2680  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.45 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0208  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.93 
 
 		 459 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.21 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.21 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  30.98 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.55 
 
 		 456 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  28.8 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  28.02 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  30.88 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 474 aa  95.1  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  29.64 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.69 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.04 
 
 		 457 aa  94  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  32.07 
 
 		 474 aa  94  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.83 
 
 		 460 aa  94  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  28.52 
 
 		 472 aa  93.6  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.29 
 
 		 457 aa  93.6  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.97 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  36.41 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.07 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.74 
 
 		 466 aa  93.2  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.36 
 
 		 459 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.07 
 
 		 474 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  35.87 
 
 		 453 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  31.62 
 
 		 489 aa  92.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 		 447 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  31.2 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.5 
 
 		 470 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  30.94 
 
 		 474 aa  92  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.35 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  27.13 
 
 		 601 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.19 
 
 		 461 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  23.9 
 
 		 481 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 472 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  32.84 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  32.84 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  32.84 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.46 
 
 		 460 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.69 
 
 		 486 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.34 
 
 		 470 aa  90.9  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2502  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.84 
 
 		 482 aa  90.5  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.207618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 		 479 aa  90.5  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  31.15 
 
 		 468 aa  90.5  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 		 461 aa  90.5  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.57 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.81 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>