More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0769 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
465 aa  961    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  37.71 
 
 
474 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  26.13 
 
 
472 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  28.28 
 
 
454 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  28.03 
 
 
461 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.37 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  26.65 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  24.9 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.78 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  26 
 
 
480 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  29.5 
 
 
459 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  35.87 
 
 
483 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  27.65 
 
 
456 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.16 
 
 
461 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.27 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  35.27 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  24.74 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.96 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.44 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.27 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.64 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.44 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  34.31 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.44 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.44 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  26.65 
 
 
453 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.06 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  24.17 
 
 
459 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  24.28 
 
 
525 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.42 
 
 
488 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  24.29 
 
 
452 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  26.77 
 
 
516 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.58 
 
 
470 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.58 
 
 
470 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.05 
 
 
890 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.04 
 
 
466 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.34 
 
 
461 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  24.95 
 
 
525 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.58 
 
 
470 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.4 
 
 
457 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.58 
 
 
470 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.47 
 
 
481 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.13 
 
 
470 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.13 
 
 
470 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.42 
 
 
470 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.58 
 
 
470 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  34.82 
 
 
485 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.13 
 
 
470 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  24.38 
 
 
459 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.95 
 
 
464 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.12 
 
 
475 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.18 
 
 
470 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.82 
 
 
473 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.67 
 
 
456 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 
484 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  37.57 
 
 
455 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.67 
 
 
470 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.55 
 
 
457 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.37 
 
 
471 aa  104  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.11 
 
 
463 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.4 
 
 
485 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  32.29 
 
 
462 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  24.17 
 
 
466 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  32.29 
 
 
462 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  34.1 
 
 
469 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.51 
 
 
476 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  31.51 
 
 
471 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.23 
 
 
460 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  31.42 
 
 
462 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  32.11 
 
 
472 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.14 
 
 
460 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.64 
 
 
469 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.93 
 
 
464 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  33.92 
 
 
514 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.64 
 
 
469 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.97 
 
 
887 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.18 
 
 
467 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  33.64 
 
 
452 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.78 
 
 
484 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1362  FAD linked oxidase domain protein  32.92 
 
 
488 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.64 
 
 
469 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  35.48 
 
 
499 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.53 
 
 
459 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  31.65 
 
 
463 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  31.65 
 
 
463 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.36 
 
 
493 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.88 
 
 
457 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  31.65 
 
 
463 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.65 
 
 
463 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.88 
 
 
457 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 
485 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.64 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  35.37 
 
 
479 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 
457 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 
472 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 
461 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.14 
 
 
495 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.08 
 
 
470 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 
463 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>