More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2406 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.64 
 
 		 517 aa  712    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 518 aa  1078    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  60.27 
 
 		 516 aa  658    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  65.95 
 
 		 514 aa  735    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  62.87 
 
 		 526 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  54.46 
 
 		 531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  53.8 
 
 		 527 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  47.69 
 
 		 520 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  45.74 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  45.6 
 
 		 542 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  45.07 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.03 
 
 		 515 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  39.61 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  39.8 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.62 
 
 		 526 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  34.76 
 
 		 528 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  34.42 
 
 		 588 aa  299  7e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 		 488 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  30.27 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.97 
 
 		 532 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  26.9 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  25.44 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  39.71 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.2 
 
 		 542 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  23.2 
 
 		 545 aa  124  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.59 
 
 		 470 aa  96.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.51 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.32 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  24.32 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  24.32 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.51 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  24 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.12 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.42 
 
 		 464 aa  94  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.12 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.68 
 
 		 470 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  24.03 
 
 		 485 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  22.96 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30.21 
 
 		 466 aa  93.2  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.32 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 		 260 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  24.37 
 
 		 459 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.71 
 
 		 460 aa  90.5  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.34 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.84 
 
 		 469 aa  88.2  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.93 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  21.81 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  23.49 
 
 		 456 aa  87.4  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  22.99 
 
 		 461 aa  87  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  24.38 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  22.59 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  22 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  31.94 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  24.61 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.86 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  24.71 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  28.01 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  27.41 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  29 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.91 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  22.11 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  23.99 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  26.86 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  25.76 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.75 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  27.41 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.9 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.31 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.15 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0707  FAD linked oxidase domain protein  25.63 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.46 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  28.14 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  27.09 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  30.08 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  28.95 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  26.87 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4383  FAD linked oxidase domain protein  26.25 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.471447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  32.98 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48310  FAD linked oxidoreductase  30.89 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.49 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  25.36 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  25.52 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.29 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.7 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  23.37 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  24.58 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.3 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.27 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.27 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  22.27 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.88 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  23.42 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.39 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  26.63 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.63 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.65 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>