More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4383 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4383  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
430 aa  875    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.471447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0707  FAD linked oxidase domain protein  68.36 
 
 
433 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.56 
 
 
462 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 
472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  31.04 
 
 
459 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.77 
 
 
459 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  30.6 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  30.77 
 
 
459 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.36 
 
 
470 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.16 
 
 
470 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.84 
 
 
459 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 
466 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  28.54 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 
460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.43 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.19 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.43 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.95 
 
 
470 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.95 
 
 
470 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.95 
 
 
470 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.95 
 
 
470 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.19 
 
 
470 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.71 
 
 
470 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.82 
 
 
459 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.39 
 
 
459 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  27.15 
 
 
466 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.11 
 
 
469 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 
457 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.82 
 
 
460 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.61 
 
 
457 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 
462 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  27.81 
 
 
474 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 
461 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  27.73 
 
 
461 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.32 
 
 
460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 
461 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  27.75 
 
 
462 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.66 
 
 
468 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.25 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  27.38 
 
 
462 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  27.75 
 
 
462 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.35 
 
 
471 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.86 
 
 
457 aa  153  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
454 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.54 
 
 
466 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  28.29 
 
 
479 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.17 
 
 
461 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  27.49 
 
 
456 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  28.16 
 
 
466 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  25.61 
 
 
461 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.85 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.86 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.46 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25 
 
 
471 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.65 
 
 
473 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.26 
 
 
470 aa  146  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  26.36 
 
 
481 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.73 
 
 
460 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  26.42 
 
 
474 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  26.95 
 
 
462 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.47 
 
 
459 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  26.84 
 
 
462 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  25.94 
 
 
485 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  26.79 
 
 
461 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.68 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  26.54 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  27.95 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.96 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  27.42 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.45 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.39 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.68 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  24.53 
 
 
464 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  26 
 
 
481 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  24.02 
 
 
499 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  26.17 
 
 
461 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  32.97 
 
 
452 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  26.56 
 
 
457 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.44 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.48 
 
 
474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.88 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.47 
 
 
466 aa  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  25.5 
 
 
487 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.97 
 
 
452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  28.14 
 
 
489 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.38 
 
 
890 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  27.42 
 
 
495 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  25.33 
 
 
461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  26.29 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  25.33 
 
 
461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.83 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  25.42 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  25.11 
 
 
499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.49 
 
 
461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.07 
 
 
460 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>