More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3838 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 517 aa  1078    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  63.64 
 
 		 518 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  68.17 
 
 		 526 aa  739    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  63.64 
 
 		 516 aa  700    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  65.89 
 
 		 514 aa  732    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  54.75 
 
 		 531 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  53.61 
 
 		 527 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  48.81 
 
 		 542 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  47.06 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  48.85 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.94 
 
 		 515 aa  448  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  45.75 
 
 		 518 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  41.15 
 
 		 525 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  39.41 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  41.33 
 
 		 525 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.55 
 
 		 526 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  34.86 
 
 		 588 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  33.92 
 
 		 528 aa  309  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.6 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 518 aa  190  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.37 
 
 		 542 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  32.41 
 
 		 408 aa  166  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  27 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  26.54 
 
 		 550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.37 
 
 		 532 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  25.69 
 
 		 545 aa  149  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  25.6 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 		 260 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.98 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  25.49 
 
 		 461 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  26.64 
 
 		 479 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  23.72 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  29.6 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.51 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.42 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  24.4 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  31.8 
 
 		 470 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.8 
 
 		 470 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.8 
 
 		 470 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.42 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  23.69 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  31.42 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  31.42 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  31.42 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.8 
 
 		 470 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  26.64 
 
 		 457 aa  90.5  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.12 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.42 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  26.35 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.21 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  24.31 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  23.63 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  25.15 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  24.56 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.62 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  22.82 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.09 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  22.82 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  24.3 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.32 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  28.49 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.42 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  23.32 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  23.95 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.8 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.57 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.43 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  24.85 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  24.85 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  24.03 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  28.49 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  28.49 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  28.49 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  24.54 
 
 		 499 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  28.49 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  29.57 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.19 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  30.43 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.57 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.96 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.96 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.96 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.96 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.11 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  23.2 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.96 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  27.23 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  27.23 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  24.12 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.43 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  23.17 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.74 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  22.25 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  24.34 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.39 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>