More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2962 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  64.31 
 
 		 543 aa  720    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 542 aa  1116    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  50.7 
 
 		 526 aa  545  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  50.7 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.81 
 
 		 517 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  49.6 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  46.12 
 
 		 527 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  45.6 
 
 		 518 aa  487  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  45.16 
 
 		 531 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  42.69 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.04 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  40.04 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  42.22 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  40.9 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  39.92 
 
 		 525 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.06 
 
 		 526 aa  352  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  35.15 
 
 		 528 aa  312  9e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  32.96 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.54 
 
 		 488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  44.78 
 
 		 408 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.38 
 
 		 542 aa  163  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  26.45 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  27.55 
 
 		 550 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  26.26 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  36.4 
 
 		 532 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.23 
 
 		 260 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.42 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  23.01 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.84 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  21.8 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  25.49 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  21.99 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.95 
 
 		 465 aa  97.1  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  23.27 
 
 		 466 aa  97.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  31.1 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  22.84 
 
 		 495 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  24.31 
 
 		 469 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  24.31 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  24.31 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  24.1 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.1 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.77 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.1 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.1 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  25.64 
 
 		 474 aa  90.1  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.69 
 
 		 457 aa  87.8  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  23.47 
 
 		 469 aa  87.4  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  24.36 
 
 		 462 aa  87.4  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  23.83 
 
 		 473 aa  87.4  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  22.34 
 
 		 565 aa  87  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  23.4 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.97 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  23.17 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.7 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.67 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.83 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.83 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  22.83 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  24.42 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  32.99 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.4 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  24.35 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.47 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.46 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  28.76 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.45 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  27.06 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.34 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.13 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  27.5 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.94 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  26.52 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.71 
 
 		 890 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.68 
 
 		 887 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.09 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  24.42 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  23.42 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2767  FAD linked oxidase-like  28.3 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  22.57 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  23.83 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.27 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  28.5 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.03 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.43 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  26.83 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 		 479 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04140  hypothetical protein  32.74 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  28.22 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>