More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2125 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  100 
 
 
531 aa  1108    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  62.48 
 
 
520 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  85.58 
 
 
527 aa  978    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  57.44 
 
 
514 aa  631  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  56.81 
 
 
526 aa  623  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  56.93 
 
 
518 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  54.46 
 
 
518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.75 
 
 
517 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  52.4 
 
 
516 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  47.32 
 
 
543 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  45.16 
 
 
542 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.95 
 
 
515 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  38.7 
 
 
519 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  40.27 
 
 
525 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  40.08 
 
 
525 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.53 
 
 
526 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  35.4 
 
 
588 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  33.9 
 
 
528 aa  306  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.87 
 
 
488 aa  269  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.7 
 
 
532 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  25.54 
 
 
550 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  24.71 
 
 
557 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  25.25 
 
 
542 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  36.5 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  23.21 
 
 
545 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.52 
 
 
260 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  23.55 
 
 
479 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 
465 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  23.78 
 
 
461 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  23.69 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.72 
 
 
459 aa  87.8  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  34.46 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  22.5 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  23.05 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  27.76 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  27.42 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  23.3 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.89 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  30.27 
 
 
453 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  23.63 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  29.47 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.37 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.2 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  21.29 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  21.29 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  28.78 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.76 
 
 
468 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.3 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  26.2 
 
 
463 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  27.6 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  26.69 
 
 
474 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.33 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.83 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  22.9 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  25.09 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  27.14 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.47 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.14 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  27.6 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  25.46 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.46 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.14 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  25.46 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.14 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.46 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.14 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.43 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.49 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  27.2 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.19 
 
 
475 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  22.54 
 
 
462 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.17 
 
 
492 aa  77  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.02 
 
 
497 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  23.77 
 
 
461 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.75 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  25.94 
 
 
471 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.38 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  24.72 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  26.37 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  28.95 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.63 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.57 
 
 
469 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  29.2 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 
472 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.44 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.2 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  27.6 
 
 
485 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.99 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.99 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  23.37 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.03 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>