More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2847 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
527 aa  1101    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  85.58 
 
 
531 aa  978    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  62.36 
 
 
520 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  57.06 
 
 
514 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  56.05 
 
 
526 aa  604  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  56.17 
 
 
518 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  53.8 
 
 
518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.61 
 
 
517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  51.44 
 
 
516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  46.55 
 
 
543 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  46.12 
 
 
542 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.72 
 
 
515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  38.51 
 
 
519 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  40.27 
 
 
525 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  40.08 
 
 
525 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.81 
 
 
526 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  34.99 
 
 
528 aa  322  9.000000000000001e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  34.75 
 
 
588 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.41 
 
 
488 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 
518 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.75 
 
 
532 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  25.84 
 
 
550 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  25.48 
 
 
557 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.8 
 
 
542 aa  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  37.02 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  21.91 
 
 
545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 
260 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.37 
 
 
465 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  22.94 
 
 
479 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  24.08 
 
 
470 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  24.08 
 
 
470 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  23.88 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.88 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  23.69 
 
 
470 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  23.2 
 
 
472 aa  91.3  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.88 
 
 
470 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.69 
 
 
470 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.69 
 
 
470 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.15 
 
 
470 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.5 
 
 
470 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.5 
 
 
470 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 
453 aa  87.4  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  23 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  23.16 
 
 
466 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  23.8 
 
 
458 aa  86.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  35.03 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  23 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  30.26 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.38 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  31.06 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  23.67 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  26.91 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.01 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.13 
 
 
457 aa  84  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.48 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  22.01 
 
 
471 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.38 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.48 
 
 
497 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.54 
 
 
492 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.48 
 
 
497 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.48 
 
 
497 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.48 
 
 
497 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.84 
 
 
477 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.48 
 
 
497 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.4 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  23.31 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  29.33 
 
 
474 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  23.9 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.29 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.79 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  23.12 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.24 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  28.44 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  22.93 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 
470 aa  80.1  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  28.12 
 
 
472 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.05 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.06 
 
 
488 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.73 
 
 
459 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  26.8 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  28.81 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  22.6 
 
 
565 aa  79.3  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  28.81 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1344  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.33 
 
 
460 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.230995  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  22.41 
 
 
460 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.97 
 
 
474 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  23.12 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  26.8 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.12 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  23.12 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  29.26 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>