205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1184 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
482 aa  936    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.19 
 
 
260 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.81 
 
 
526 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  26.11 
 
 
514 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  41.7 
 
 
532 aa  124  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.58 
 
 
517 aa  123  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  26.74 
 
 
516 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  26.43 
 
 
518 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.75 
 
 
531 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 
525 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 
543 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 
542 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  28.51 
 
 
525 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  26.85 
 
 
528 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.79 
 
 
526 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  35.03 
 
 
527 aa  86.7  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  32.37 
 
 
557 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  23.63 
 
 
588 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  25.16 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  26.01 
 
 
519 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  31.41 
 
 
520 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  29.24 
 
 
542 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  32 
 
 
550 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  34.21 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  27.02 
 
 
481 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  23.78 
 
 
485 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  33.49 
 
 
408 aa  63.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.26 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  30.59 
 
 
545 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.64 
 
 
475 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.37 
 
 
519 aa  60.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  28.03 
 
 
497 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.61 
 
 
470 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.5 
 
 
475 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  27.39 
 
 
497 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.46 
 
 
488 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  31.65 
 
 
472 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.19 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.83 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.87 
 
 
481 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  27.62 
 
 
470 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  29.06 
 
 
489 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.06 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  28.49 
 
 
469 aa  55.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  26.67 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 
468 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  27.62 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  30.69 
 
 
473 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  30.39 
 
 
470 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  30.16 
 
 
473 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 
473 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  35.81 
 
 
455 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  23.73 
 
 
459 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  26.75 
 
 
461 aa  53.5  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
483 aa  53.5  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  33.99 
 
 
469 aa  53.5  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.39 
 
 
481 aa  53.5  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 
537 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.12 
 
 
520 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.84 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.84 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 
474 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1899  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.18 
 
 
496 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  27.89 
 
 
477 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  29.1 
 
 
473 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  34.23 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  28.02 
 
 
467 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 
473 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.93 
 
 
497 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
518 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  23.39 
 
 
459 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  26.3 
 
 
517 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  25.27 
 
 
499 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  28.93 
 
 
497 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.27 
 
 
476 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 
520 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.81 
 
 
472 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.42 
 
 
470 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  27.13 
 
 
470 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  22.57 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.21 
 
 
497 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.21 
 
 
497 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.21 
 
 
497 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.19 
 
 
471 aa  50.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.21 
 
 
477 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.74 
 
 
486 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.21 
 
 
497 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.64 
 
 
480 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  28.93 
 
 
499 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  28.93 
 
 
499 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  27.13 
 
 
470 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  26.99 
 
 
458 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  30.57 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>