More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1706 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 526 aa  1066    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  76.05 
 
 		 525 aa  825    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  76.81 
 
 		 525 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.79 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  44.08 
 
 		 519 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  39.73 
 
 		 588 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  40.46 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  43.55 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  42.83 
 
 		 526 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.55 
 
 		 517 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  42.25 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  39.62 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  40.53 
 
 		 531 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  39.81 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  40.66 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  39.06 
 
 		 542 aa  352  8e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  35.98 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  35.56 
 
 		 518 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.81 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 		 518 aa  249  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  37.56 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  27.27 
 
 		 532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  23.72 
 
 		 557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  23.48 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.6 
 
 		 260 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  21.23 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  23.47 
 
 		 550 aa  99.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  24.56 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.19 
 
 		 459 aa  94.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  25.43 
 
 		 459 aa  90.1  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 		 466 aa  90.1  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  27.82 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  23.14 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 465 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.07 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 		 485 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  27 
 
 		 466 aa  86.7  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  34.33 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  29.26 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  29.26 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  34.78 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.26 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  29.26 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.26 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.95 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.82 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.95 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  30.83 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  24.43 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.95 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.95 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.95 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.6 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  30.4 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  30.4 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.86 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  24.06 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  26.12 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.17 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  23.86 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2767  FAD linked oxidase-like  29.08 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  31.28 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  29.61 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  25.45 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.06 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  30.52 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.52 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  24.53 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.07 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  30.52 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  29.11 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.73 
 
 		 488 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.03 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  26.07 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  26.07 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.52 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.81 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.52 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.52 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  23.92 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.4 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.52 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.85 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25.85 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.85 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.85 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25.85 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  28.64 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  21.64 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  25.93 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.64 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.43 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  30.85 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>