More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3112 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  100 
 
 		 532 aa  1058    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  28.3 
 
 		 557 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  29.19 
 
 		 550 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  29.67 
 
 		 542 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  27.18 
 
 		 518 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  25.28 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  26.77 
 
 		 514 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 		 543 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.54 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  28.84 
 
 		 542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.57 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  24.6 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.55 
 
 		 531 aa  150  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.46 
 
 		 515 aa  148  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  25.33 
 
 		 588 aa  147  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.32 
 
 		 260 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  26.17 
 
 		 520 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  27.96 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  27.78 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  25.85 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  25.78 
 
 		 518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  23.36 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  41.7 
 
 		 482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.56 
 
 		 488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 		 518 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  33.72 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  28.76 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.34 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  36.84 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.64 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.72 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  31.9 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  31.14 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  31.22 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  31.22 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 474 aa  67  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  31.22 
 
 		 499 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  31.07 
 
 		 457 aa  67  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  32.5 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.02 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  26.92 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  30.88 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.92 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  34.84 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  29.58 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  26.92 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.4 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.29 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  27.83 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  30.3 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  27.53 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  33.63 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.42 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  30.3 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.67 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.86 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.86 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.86 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.86 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.86 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  26.54 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.36 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.36 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  28.76 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.36 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.36 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  32.16 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.54 
 
 		 463 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  32.54 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.93 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.03 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  29 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.36 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  28.83 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.95 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  28.88 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.15 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.17 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.97 
 
 		 460 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  28.9 
 
 		 475 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  33.49 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  29.13 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.73 
 
 		 457 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.85 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.36 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  26.15 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.15 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.98 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>