31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4397 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  60.25 
 
 		 550 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  100 
 
 		 557 aa  1154    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  50.36 
 
 		 542 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  47.71 
 
 		 545 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  28.23 
 
 		 532 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 		 543 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  25.44 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  27 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  26.45 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.42 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  24.67 
 
 		 516 aa  153  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  23.89 
 
 		 514 aa  148  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  26.07 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  25.48 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.71 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  23.48 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  24.43 
 
 		 588 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  22.6 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.72 
 
 		 526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  22.27 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  22.86 
 
 		 528 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  23.12 
 
 		 518 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.97 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 		 260 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 488 aa  87.4  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  30.06 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  21.9 
 
 		 518 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06721  FAD linked oxidase, N-terminal  27.21 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7674  oxidoreductase  25.5 
 
 		 566 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.218011  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07011  FAD linked oxidase, N-terminal  29.46 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.979719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>