30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01320 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  100 
 
 		 545 aa  1138    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  47.71 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  45.55 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  47.42 
 
 		 542 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  25.28 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  26.76 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  26.26 
 
 		 542 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.69 
 
 		 517 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  25.37 
 
 		 514 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  23.54 
 
 		 543 aa  143  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  24.01 
 
 		 526 aa  133  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  24.03 
 
 		 525 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  23.2 
 
 		 518 aa  124  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  23.45 
 
 		 588 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  23.21 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  21.91 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  23.54 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  24.06 
 
 		 520 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  23.32 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  23.41 
 
 		 519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.64 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.23 
 
 		 526 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 		 518 aa  90.9  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.55 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  30.59 
 
 		 482 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  19.07 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  26.35 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1899  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.04 
 
 		 496 aa  43.5  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.78 
 
 		 498 aa  43.5  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>