More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0959 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
260 aa  524  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  62.19 
 
 
482 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  46.32 
 
 
532 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  35.57 
 
 
527 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  34.52 
 
 
531 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  34.25 
 
 
543 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  32.44 
 
 
516 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  34.06 
 
 
528 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  39.23 
 
 
542 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  33.47 
 
 
526 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  35.22 
 
 
525 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  37.95 
 
 
514 aa  105  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 
525 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.6 
 
 
526 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  34.6 
 
 
518 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 
517 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.44 
 
 
515 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  31.89 
 
 
520 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  32.08 
 
 
519 aa  98.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  32.2 
 
 
557 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  31.12 
 
 
518 aa  92  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  32.98 
 
 
542 aa  88.6  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  28.57 
 
 
588 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  30.85 
 
 
550 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  31.25 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.99 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
474 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  30.3 
 
 
489 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.17 
 
 
476 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  31.2 
 
 
474 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.1 
 
 
497 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  28.63 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  29.44 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.08 
 
 
461 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  28.93 
 
 
497 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  28.23 
 
 
474 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 
481 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.8 
 
 
470 aa  68.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  30.29 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 
491 aa  66.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  28.39 
 
 
478 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  29.38 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  28.43 
 
 
497 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  29.54 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.99 
 
 
475 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.35 
 
 
519 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  25.43 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  24.8 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  29.8 
 
 
499 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  26.12 
 
 
466 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  29.8 
 
 
499 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.08 
 
 
464 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.13 
 
 
502 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.58 
 
 
481 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.7 
 
 
498 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.97 
 
 
474 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.7 
 
 
498 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.7 
 
 
498 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.89 
 
 
468 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 
468 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.83 
 
 
470 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.34 
 
 
473 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 
470 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  26.61 
 
 
497 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.69 
 
 
497 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.95 
 
 
497 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  28.88 
 
 
476 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 
518 aa  63.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.4 
 
 
471 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 
470 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  27.4 
 
 
471 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2767  FAD linked oxidase-like  27.31 
 
 
528 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
470 aa  63.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.43 
 
 
499 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  27.92 
 
 
497 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  29.95 
 
 
499 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
470 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 
452 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  29.23 
 
 
479 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  28.29 
 
 
474 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  24.9 
 
 
459 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  28.15 
 
 
477 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 
496 aa  62  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  30.43 
 
 
499 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.4 
 
 
485 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  29.95 
 
 
499 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  24.23 
 
 
461 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  32.21 
 
 
498 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  27.8 
 
 
474 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.8 
 
 
456 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.16 
 
 
481 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 
480 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.83 
 
 
457 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  24.9 
 
 
459 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.51 
 
 
472 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  28.7 
 
 
480 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  28.5 
 
 
509 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
470 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.34 
 
 
470 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>