More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3479 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  60.98 
 
 
516 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  62.45 
 
 
518 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  100 
 
 
526 aa  1088    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  65.88 
 
 
514 aa  712    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.17 
 
 
517 aa  739    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  56.81 
 
 
531 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  56.05 
 
 
527 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  50.1 
 
 
542 aa  549  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  49.04 
 
 
543 aa  544  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  49.61 
 
 
520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.38 
 
 
515 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  46.99 
 
 
518 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  42.27 
 
 
519 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  43.44 
 
 
525 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 
525 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.83 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  33.96 
 
 
588 aa  319  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  34.05 
 
 
528 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.6 
 
 
488 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 
518 aa  202  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.49 
 
 
542 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  40.59 
 
 
408 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  24.42 
 
 
557 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  26.54 
 
 
532 aa  153  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  25.51 
 
 
550 aa  146  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  24.01 
 
 
545 aa  133  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  25.86 
 
 
482 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  25.3 
 
 
479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.47 
 
 
260 aa  106  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 
466 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.69 
 
 
470 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.03 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.03 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.03 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.44 
 
 
470 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.82 
 
 
470 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 
461 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.82 
 
 
470 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.44 
 
 
470 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.44 
 
 
470 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.44 
 
 
470 aa  94  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.84 
 
 
459 aa  93.2  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  25.57 
 
 
466 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.07 
 
 
470 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.24 
 
 
485 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.36 
 
 
466 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  23.11 
 
 
471 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  22.48 
 
 
471 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.51 
 
 
461 aa  89  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.14 
 
 
457 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  23.32 
 
 
466 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.15 
 
 
460 aa  87.8  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.01 
 
 
459 aa  87.4  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0769  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 
465 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  24.52 
 
 
459 aa  86.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  23.94 
 
 
476 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  22.86 
 
 
459 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  22.66 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  31.07 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  23.26 
 
 
560 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  22.18 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.95 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  29.34 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  24.31 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.09 
 
 
473 aa  84.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  29.13 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  22.27 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.67 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  23.99 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86747  mitochondrial enzyme D-lactate ferricytochrome c oxidoreductase  29.11 
 
 
587 aa  81.3  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180539  normal  0.534514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  21.22 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.03 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  29.17 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  26.87 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  29.95 
 
 
495 aa  80.1  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  26.49 
 
 
462 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  29.78 
 
 
480 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.61 
 
 
468 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  23.23 
 
 
462 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.54 
 
 
469 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  25.71 
 
 
462 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.3 
 
 
464 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  33.17 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  29.2 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  31.11 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  24.8 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  25.23 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2767  FAD linked oxidase-like  30.71 
 
 
528 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  26.64 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.64 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  28.14 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  31.44 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  26.64 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.88 
 
 
496 aa  77  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 
469 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>