115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1490 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1490  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 408 aa  815    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.96 
 
 		 488 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1652  twin-arginine translocation pathway signal  46.27 
 
 		 543 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2962  twin-arginine translocation pathway signal  44.78 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.41 
 
 		 517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  37.64 
 
 		 516 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  34.62 
 
 		 514 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3479  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  40.59 
 
 		 526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3875  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.9 
 
 		 515 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2406  FAD linked oxidase-like  39.71 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2126  FAD linked oxidase-like  31.43 
 
 		 520 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1669  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 525 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0689337  normal  0.948361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2846  FAD linked oxidase domain protein  29.85 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2781  putative flavoprotein subunit p- cresol methylhydroxylase, PchF  31.92 
 
 		 525 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871122  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2125  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  36.5 
 
 		 531 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 		 526 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2847  FAD linked oxidase domain protein  37.02 
 
 		 527 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1492  vanillyl-alcohol oxidase  30.34 
 
 		 519 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2876  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07068  aryl-alcohol oxidase; vanillyl-alcohol oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G09500)  34.71 
 
 		 588 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301696  normal  0.302303 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01642  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 		 518 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3112  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  28.76 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4397  FAD-binding protein  30.06 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1202  4-cresol dehydrogenase (hydroxylating)  27.95 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0526  FAD-binding protein  28.48 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1184  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.58 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  24.82 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  31.07 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.5 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01320  FAD-binding protein  26.35 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.861345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  23.44 
 
 		 473 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  30.59 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0959  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  31.55 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  30.11 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  29.38 
 
 		 497 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.38 
 
 		 497 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.38 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.51 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.38 
 
 		 497 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.38 
 
 		 497 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.38 
 
 		 497 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.38 
 
 		 497 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.17 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  27.47 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  26.35 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  28.02 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.32 
 
 		 452 aa  50.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 		 475 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  29.19 
 
 		 469 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.11 
 
 		 463 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  28.85 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  28.85 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  29.19 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  28.85 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  24.05 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.19 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  29.19 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.85 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  28.82 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  27.34 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.57 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.78 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  27.6 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  28.57 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.57 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.9 
 
 		 470 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.57 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.57 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 		 472 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.21 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  26.64 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.56 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.75 
 
 		 474 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 		 461 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.96 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.77 
 
 		 467 aa  46.6  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  29.68 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  31.31 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  27.66 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  28.74 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  29.68 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  32.12 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  27.66 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.31 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  25.18 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  26.42 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>