More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1601 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  84.05 
 
 		 397 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  85.32 
 
 		 397 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  84.3 
 
 		 397 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  95.7 
 
 		 395 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  91.14 
 
 		 400 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  85.57 
 
 		 397 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  85.32 
 
 		 397 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  84.05 
 
 		 397 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  100 
 
 		 395 aa  779    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  85.82 
 
 		 397 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  80.25 
 
 		 400 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  80 
 
 		 400 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  82.53 
 
 		 400 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  81.52 
 
 		 400 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  75.95 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  76.2 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  75.7 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  78.73 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  77.97 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  76.71 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  74.94 
 
 		 404 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  74.11 
 
 		 433 aa  586  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  75.19 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  67.68 
 
 		 403 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  69.21 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  68.88 
 
 		 402 aa  544  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  70.38 
 
 		 402 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  70.13 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  69.87 
 
 		 402 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  70.63 
 
 		 406 aa  531  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  70.38 
 
 		 402 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  65.32 
 
 		 405 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  70.13 
 
 		 402 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  65.64 
 
 		 405 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  67.85 
 
 		 402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  69.65 
 
 		 402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  66.24 
 
 		 402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  65.64 
 
 		 405 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  70.41 
 
 		 400 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  69.62 
 
 		 460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  64.5 
 
 		 405 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  63.5 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  62.97 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  64.14 
 
 		 406 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  62.97 
 
 		 406 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  62.03 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  62.28 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  62.72 
 
 		 400 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  62.94 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  59.95 
 
 		 404 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  39.9 
 
 		 408 aa  252  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  40.59 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  39.45 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  38.96 
 
 		 411 aa  249  8e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  38.63 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  38.97 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  41.22 
 
 		 408 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  41.03 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  40.14 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  36.91 
 
 		 444 aa  229  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  38.24 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  37.56 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  34.55 
 
 		 460 aa  222  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  36.49 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  36.86 
 
 		 483 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  36.46 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  35.22 
 
 		 1209 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.53 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  34.89 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  36.25 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  34.98 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  34.98 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  32.68 
 
 		 458 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  37.38 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  34.26 
 
 		 469 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  35.02 
 
 		 497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  36.03 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  35.36 
 
 		 471 aa  196  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  33.99 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  34.89 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  33.33 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  35.05 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  35.18 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  35.75 
 
 		 515 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  35.75 
 
 		 515 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  35.92 
 
 		 447 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  34.59 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  37.16 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  34.03 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  34.75 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  36.92 
 
 		 439 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  35.19 
 
 		 441 aa  186  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  35.71 
 
 		 511 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.75 
 
 		 1018 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  35.25 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  34.24 
 
 		 518 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  36.76 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  35.47 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  34.73 
 
 		 644 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.84 
 
 		 1264 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>