More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1302 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  100 
 
 		 417 aa  818    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  70.27 
 
 		 402 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  66.18 
 
 		 403 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  67.33 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  65.93 
 
 		 433 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  67.24 
 
 		 405 aa  530  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  63.77 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  67.08 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  68.29 
 
 		 402 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  67.8 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  64.84 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  65.53 
 
 		 400 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  67.82 
 
 		 400 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  68.05 
 
 		 402 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  65.35 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  65.19 
 
 		 404 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  68.54 
 
 		 402 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  64.27 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  64 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  64.76 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  70.52 
 
 		 460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  65.26 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  68.05 
 
 		 402 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  66.34 
 
 		 400 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  65.53 
 
 		 402 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  65.26 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  64.27 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  62.59 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  62.59 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  64.76 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  69.53 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  65.01 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  63.66 
 
 		 402 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  64.27 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  66.83 
 
 		 400 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  68.32 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  62.56 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  65.51 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  64.27 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  63.5 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  64.02 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  61.59 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  62.56 
 
 		 400 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  60.87 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  64.06 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  64.08 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  59.66 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  59.66 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  59.9 
 
 		 405 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  58.25 
 
 		 404 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  38.13 
 
 		 411 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  37.17 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  37.65 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  37.87 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  38.31 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  38.7 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  38.67 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  38.7 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  38.74 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  37.35 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.59 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  36.04 
 
 		 461 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  36.12 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  37.23 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  37.68 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  35.32 
 
 		 468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  35.55 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  34.1 
 
 		 478 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  36.21 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  37.56 
 
 		 483 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  33.97 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  36.07 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  32.26 
 
 		 478 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  36.07 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  34.06 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  36.98 
 
 		 409 aa  199  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  34.57 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  34.77 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  35.7 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  34.36 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  34.36 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  36.17 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  36.28 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  35.29 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  33.5 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  36.32 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  33.64 
 
 		 497 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  33.56 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  32.36 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  35.54 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  37.71 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  34.68 
 
 		 420 aa  186  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  33.25 
 
 		 1209 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0522  Rh family protein/ammonium transporter  35.87 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395518  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  34.46 
 
 		 437 aa  183  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  33.5 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  32.16 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.92 
 
 		 1018 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  35.01 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  34.9 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>