More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0443 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  100 
 
 		 404 aa  798    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  76.37 
 
 		 406 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  74.88 
 
 		 406 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  72.52 
 
 		 406 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  71.68 
 
 		 406 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  73.25 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  72.03 
 
 		 406 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  72.29 
 
 		 405 aa  594  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  61.6 
 
 		 400 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  62.22 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  59.6 
 
 		 403 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  60.25 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  60.25 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  60.64 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  62.38 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  62.28 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  61.63 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  60.59 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  61.1 
 
 		 400 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  61.63 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  60.55 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  60.25 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  63.37 
 
 		 402 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  61.35 
 
 		 400 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  62.84 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  60.6 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  62.22 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  61.25 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  58.56 
 
 		 400 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  60.35 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  58.25 
 
 		 417 aa  454  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  62.13 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  57.61 
 
 		 405 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  59.1 
 
 		 400 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  59.8 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  59.35 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  59.06 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  60.1 
 
 		 400 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  60.89 
 
 		 402 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  60.1 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  60.4 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  59.95 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  60.1 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  59.35 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  59.35 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  60.15 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  59.6 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  59.1 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  58.38 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  56.57 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  39.61 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  39.61 
 
 		 411 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  39.32 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  38.89 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  39.42 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  36.97 
 
 		 408 aa  242  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  39.3 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  39.05 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  39.42 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  38.65 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  36.02 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  35.04 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  35.17 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  36.11 
 
 		 384 aa  209  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  34.47 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  35.19 
 
 		 449 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  33.25 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  33.25 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  34.84 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  35.02 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  31.6 
 
 		 469 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  34.89 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  33.02 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  34.45 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  34.45 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  35.73 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  32.38 
 
 		 478 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  33.17 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  32.77 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  33 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  35.87 
 
 		 489 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  33.17 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  34.29 
 
 		 458 aa  183  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  31.9 
 
 		 478 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  32.79 
 
 		 525 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  30.5 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  34.29 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.16 
 
 		 1016 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  33.17 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 		 1209 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  33.89 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  33.25 
 
 		 482 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  32.71 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  32.78 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  33.9 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  32.8 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  32.22 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  33.74 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  35.86 
 
 		 644 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  33.1 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>