More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1221 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  85.22 
 
 		 406 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  100 
 
 		 406 aa  801    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  86.7 
 
 		 406 aa  735    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  82.27 
 
 		 406 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  80.69 
 
 		 405 aa  670    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  82.27 
 
 		 406 aa  698    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  85 
 
 		 400 aa  700    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  76.37 
 
 		 404 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  63.82 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  62.56 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  62.88 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  63.82 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  62.47 
 
 		 400 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  63.98 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  63.04 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  62.41 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  63.82 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  61.75 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  60.25 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  63.13 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  63.96 
 
 		 395 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  59.8 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  59.8 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  63.48 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  63.34 
 
 		 400 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  60.05 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  61.96 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  63.22 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  60.41 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  62.97 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  61.65 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  60.75 
 
 		 402 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  62.31 
 
 		 400 aa  461  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  63.22 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  62.97 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  62.97 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  61.15 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  59.85 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  60.96 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  62.94 
 
 		 395 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  60.9 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  60.45 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  59.85 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  61.14 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  61.39 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  63.12 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  58.46 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  59.51 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  62.38 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  57.79 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  41.35 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  41.3 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  39.23 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  40.34 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  40.82 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  40.73 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  41.11 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  41.05 
 
 		 408 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  40.57 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  41.03 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  37.32 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  37.59 
 
 		 460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  36.75 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  36.9 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.71 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  34.81 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  34.49 
 
 		 469 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  35.66 
 
 		 449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  35.87 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  35.87 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  36.05 
 
 		 483 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  36.19 
 
 		 478 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  36.25 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  35.48 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  35.48 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  37.81 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  36.65 
 
 		 441 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  33.49 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  36.39 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  33.88 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  36.41 
 
 		 437 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  35.24 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  35.18 
 
 		 409 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  33.91 
 
 		 476 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  33.72 
 
 		 525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  35.7 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  35.56 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  35.45 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  33.41 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  36.39 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  33.82 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  34.76 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  33.41 
 
 		 462 aa  192  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  33.65 
 
 		 441 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  34.35 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  35.49 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  33.89 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  35.71 
 
 		 416 aa  189  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.74 
 
 		 1016 aa  189  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  34.69 
 
 		 644 aa  189  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>