More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0722 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  98.49 
 
 
397 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  85.06 
 
 
395 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  85.57 
 
 
395 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  100 
 
 
397 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  95.97 
 
 
397 aa  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  99.24 
 
 
397 aa  777    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  96.22 
 
 
397 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  85.39 
 
 
400 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  96.22 
 
 
397 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  99.75 
 
 
397 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  76.83 
 
 
400 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  78.84 
 
 
400 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  79.6 
 
 
400 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  78.59 
 
 
400 aa  617  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  77.33 
 
 
400 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  76.32 
 
 
400 aa  614  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  78.09 
 
 
400 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  75.06 
 
 
400 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  73.82 
 
 
404 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  75.06 
 
 
400 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  76.57 
 
 
400 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  73.6 
 
 
433 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  73.8 
 
 
400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  70.26 
 
 
402 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  69.04 
 
 
399 aa  557  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  69.02 
 
 
403 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  71.39 
 
 
402 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  71.39 
 
 
402 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  71.14 
 
 
402 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  70.63 
 
 
402 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  70.4 
 
 
402 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  66.07 
 
 
405 aa  525  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  70.15 
 
 
406 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  66.07 
 
 
405 aa  525  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  69.31 
 
 
402 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  69.73 
 
 
402 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  69.23 
 
 
460 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  64.3 
 
 
405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  63.28 
 
 
405 aa  510  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  65.01 
 
 
417 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  65.82 
 
 
402 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  69.35 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  62.97 
 
 
406 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  63.29 
 
 
406 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  62.28 
 
 
406 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  62.53 
 
 
406 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  62.56 
 
 
400 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  62.69 
 
 
405 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  61.56 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  59.35 
 
 
404 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  39.2 
 
 
408 aa  248  9e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  38.57 
 
 
411 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  38.33 
 
 
411 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  37.84 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  37.47 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  40.39 
 
 
408 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  37.28 
 
 
411 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  40.64 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  39.66 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  37.81 
 
 
461 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  39.32 
 
 
403 aa  233  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  34.21 
 
 
460 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  36.12 
 
 
444 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  37.37 
 
 
384 aa  223  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  36.49 
 
 
468 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  35.52 
 
 
446 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.59 
 
 
445 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  34.56 
 
 
449 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  35.47 
 
 
483 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  34.78 
 
 
458 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  34.66 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  35.84 
 
 
497 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  34.32 
 
 
1209 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  36.14 
 
 
435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  36.14 
 
 
435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  35.76 
 
 
471 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  34.38 
 
 
414 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  34.79 
 
 
433 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  35.51 
 
 
409 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  36.12 
 
 
515 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  36.12 
 
 
515 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  34.78 
 
 
478 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  35.37 
 
 
441 aa  189  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  37.25 
 
 
441 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  35.65 
 
 
511 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  34.8 
 
 
422 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.16 
 
 
1262 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  35.25 
 
 
441 aa  187  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  32.87 
 
 
426 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  35.91 
 
 
439 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  35.29 
 
 
441 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  37.68 
 
 
416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  34.13 
 
 
478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  33.81 
 
 
584 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.99 
 
 
1018 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0923  ammonium transporter  36.12 
 
 
441 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  33.33 
 
 
409 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  34.31 
 
 
447 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  35.68 
 
 
442 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  33.33 
 
 
471 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>