More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1175 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  96.22 
 
 		 397 aa  743    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  98.24 
 
 		 397 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  85.32 
 
 		 395 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  84.81 
 
 		 395 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  99.24 
 
 		 397 aa  777    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  85.14 
 
 		 400 aa  693    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  100 
 
 		 397 aa  782    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  95.97 
 
 		 397 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  95.97 
 
 		 397 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  99.5 
 
 		 397 aa  779    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  76.83 
 
 		 400 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  78.84 
 
 		 400 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  77.33 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  79.6 
 
 		 400 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  78.59 
 
 		 400 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  76.57 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  78.34 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  75.06 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  73.82 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  75.31 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  76.57 
 
 		 400 aa  594  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  73.6 
 
 		 433 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  73.8 
 
 		 400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  69.02 
 
 		 403 aa  558  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  70.26 
 
 		 402 aa  554  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  69.04 
 
 		 399 aa  557  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  71.65 
 
 		 402 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  71.39 
 
 		 402 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  71.65 
 
 		 402 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  70.89 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  70.66 
 
 		 406 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  66.33 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  66.33 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  70.4 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  69.31 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  69.73 
 
 		 402 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  69.23 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  64.81 
 
 		 405 aa  521  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  63.77 
 
 		 405 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  66.33 
 
 		 402 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  65.26 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  69.35 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  62.97 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  62.28 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  62.53 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  63.29 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  62.56 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  62.69 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  61.56 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  59.35 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  39.45 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  38.82 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  38.73 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  38.08 
 
 		 411 aa  245  8e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  38.2 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  37.53 
 
 		 411 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  41 
 
 		 408 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  41 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  40.25 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  39.56 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  37.81 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  34.21 
 
 		 460 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  37.88 
 
 		 384 aa  225  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  36.12 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  36.49 
 
 		 468 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  35.77 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.83 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  34.56 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  35.47 
 
 		 483 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  34.78 
 
 		 458 aa  206  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  35.84 
 
 		 497 aa  199  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  34.43 
 
 		 469 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  36.39 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  36.39 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  36 
 
 		 471 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  35.28 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  33.83 
 
 		 1209 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  36.36 
 
 		 515 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  36.36 
 
 		 515 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  34.94 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  37.25 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  35.27 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  34.13 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  34.71 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  34.8 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  36.16 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  35.45 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  35.43 
 
 		 511 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  33.8 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  34.05 
 
 		 478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  34.29 
 
 		 584 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0923  ammonium transporter  36.36 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.66 
 
 		 1262 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  36.01 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  37.68 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  35.25 
 
 		 525 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.74 
 
 		 1018 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  36.07 
 
 		 489 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  33.57 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  34.44 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>