More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1627 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  100 
 
 		 405 aa  798    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  73.93 
 
 		 403 aa  601  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  72.21 
 
 		 402 aa  594  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  72.46 
 
 		 402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  69.08 
 
 		 402 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  68.49 
 
 		 402 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  70.15 
 
 		 406 aa  552  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  68.73 
 
 		 402 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  68.49 
 
 		 402 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  68.98 
 
 		 402 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  70.32 
 
 		 402 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  68.35 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  68.49 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  69.58 
 
 		 460 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  68.32 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  67.26 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  67.99 
 
 		 405 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  68.38 
 
 		 400 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  66.58 
 
 		 404 aa  521  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  67.61 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  65.74 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  65.47 
 
 		 400 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  64.56 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  67.01 
 
 		 400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  67.24 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  67.01 
 
 		 400 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  64.81 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  64.3 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  66.5 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  65.06 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  65.32 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  64.81 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  64.56 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  65.73 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  64.3 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  66.24 
 
 		 400 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  64.97 
 
 		 400 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  62.95 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  64.21 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  62.95 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  65.55 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  69.04 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  60.41 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  60.15 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  60.66 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  59.39 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  59.35 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  59.4 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  57.61 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  58.52 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  38.93 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  39.11 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  38.35 
 
 		 411 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  38.82 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  37.23 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  37.23 
 
 		 411 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  41.23 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  40.99 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  41.23 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  38.41 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  36.72 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  35.58 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  36.67 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  36.21 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  37.08 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  33.57 
 
 		 469 aa  195  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  34.88 
 
 		 497 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.28 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.86 
 
 		 1016 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  35.1 
 
 		 483 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  35.87 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  34.54 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  34.54 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  36.43 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 1209 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.66 
 
 		 1018 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.16 
 
 		 1262 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  33.33 
 
 		 490 aa  186  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  34.78 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  33.25 
 
 		 478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  33.97 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  33.97 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  35.1 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  34.54 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  34.24 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  33.82 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  34.06 
 
 		 478 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  31.38 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  33.65 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  34.96 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  35.28 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  35.28 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  35.62 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  34.07 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  33.25 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  32.6 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  34.31 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  34.22 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  34.07 
 
 		 422 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  34.17 
 
 		 644 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>