More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0360 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  100 
 
 		 399 aa  786    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  71.39 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  72.7 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  70.93 
 
 		 400 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  70.48 
 
 		 402 aa  564  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  69.72 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  68.27 
 
 		 397 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  66.58 
 
 		 400 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  69.72 
 
 		 402 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  69.97 
 
 		 402 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  69.72 
 
 		 402 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  68.35 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  67.42 
 
 		 404 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  66.16 
 
 		 403 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  69.9 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  69.29 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  67.85 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  71.25 
 
 		 402 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  69.04 
 
 		 397 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  69.04 
 
 		 397 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  69.29 
 
 		 397 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  69.87 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  67.69 
 
 		 405 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  67.77 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  67.69 
 
 		 405 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  70.48 
 
 		 402 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  68.27 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  69.9 
 
 		 400 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  69.62 
 
 		 400 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  66.84 
 
 		 400 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  70.51 
 
 		 402 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  69.62 
 
 		 400 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  69.37 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  67.34 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  69.21 
 
 		 395 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  69.15 
 
 		 460 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  63.84 
 
 		 405 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  69.62 
 
 		 400 aa  518  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  67.18 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  65.35 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  65.39 
 
 		 402 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  67.69 
 
 		 400 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  63.2 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  61.21 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  60.05 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  61.46 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  62.12 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  62.72 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  61.42 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  62.22 
 
 		 404 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  38.77 
 
 		 411 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  38.85 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  37.78 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  38.81 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  37.78 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  38.18 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  40.55 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  40.55 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  40.35 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  39.65 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  37.25 
 
 		 461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  37.05 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  37.5 
 
 		 445 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  35.45 
 
 		 468 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  38.19 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  36.05 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  34.96 
 
 		 483 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  35.63 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  36.92 
 
 		 441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  34.53 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  35.37 
 
 		 458 aa  209  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  35.44 
 
 		 446 aa  209  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  34.61 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  35.56 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  37.05 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  33.89 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  37.59 
 
 		 416 aa  206  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  36.71 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  36.96 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  35.38 
 
 		 409 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  34.53 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  34.53 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  35.51 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  36.96 
 
 		 416 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  35.99 
 
 		 497 aa  200  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  34.47 
 
 		 441 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  36.47 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  36.47 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1357  Rh family protein/ammonium transporter  33.88 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.442305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  34.04 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  36.96 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  36.71 
 
 		 416 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  36.71 
 
 		 416 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  36.71 
 
 		 416 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  33.98 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  34.38 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  35.23 
 
 		 518 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  35.95 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  36.75 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  36.75 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>