More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5572 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4896  glycoside hydrolase family 13 protein  81.79 
 
 
736 aa  863    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462682  hitchhiker  0.0000852595 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0286  alpha amylase family protein  73.3 
 
 
547 aa  757    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372704  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0879  alpha amylase family protein  73.3 
 
 
547 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.592303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2441  putative glycosyl hydrolase  73.3 
 
 
547 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2247  glycoside hydrolase family protein  87.07 
 
 
551 aa  923    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0754879 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1663  alpha amylase family protein  73.3 
 
 
547 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0582  alpha amylase family protein  71.64 
 
 
547 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3678  glycoside hydrolase family 13 protein  87.07 
 
 
550 aa  907    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46883  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1466  alpha amylase family protein  73.3 
 
 
547 aa  757    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4515  glycoside hydrolase family protein  87.07 
 
 
550 aa  907    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2577  alpha amylase family protein  73.11 
 
 
547 aa  756    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5572  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 
547 aa  1098    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13072  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0318  alpha amylase family protein  73.3 
 
 
547 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3849  glycoside hydrolase family 13 protein  87.07 
 
 
550 aa  907    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.770452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3746  glycoside hydrolase family 13 protein  98.9 
 
 
547 aa  1086    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260417  normal  0.176524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.39 
 
 
640 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  44.39 
 
 
640 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.08 
 
 
636 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5594  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.38 
 
 
623 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.774422  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6324  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.56 
 
 
623 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602063 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  37.79 
 
 
580 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  37.79 
 
 
580 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  37.79 
 
 
580 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  37.79 
 
 
580 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.73 
 
 
623 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5487  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.22 
 
 
619 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.570083  hitchhiker  0.000688903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.5 
 
 
623 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.5 
 
 
623 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.54 
 
 
634 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  33.9 
 
 
600 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.75 
 
 
598 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7030  glycoside hydrolase family protein  43.93 
 
 
623 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0292632  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.7 
 
 
634 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.7 
 
 
634 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05186  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase protein  40.48 
 
 
622 aa  236  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256787  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.58 
 
 
584 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1823  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.7 
 
 
580 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597034  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.43 
 
 
613 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.43 
 
 
613 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0544  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.25 
 
 
572 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6343  normal  0.630983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4051  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.94 
 
 
580 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10082  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  31.83 
 
 
604 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  39.18 
 
 
604 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40 
 
 
601 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1792  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.94 
 
 
580 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3650  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.66 
 
 
580 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.736771  normal  0.277493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.95 
 
 
629 aa  216  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  38.19 
 
 
583 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  35.51 
 
 
606 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.71 
 
 
583 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  38.12 
 
 
592 aa  203  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.56 
 
 
553 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  32.29 
 
 
625 aa  200  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.67 
 
 
618 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  36.67 
 
 
618 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4233  alpha amylase domain-containing protein  30.96 
 
 
687 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  34.67 
 
 
615 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.29 
 
 
587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.12 
 
 
603 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6810  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37 
 
 
605 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368114  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.55 
 
 
604 aa  180  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.8 
 
 
607 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.03 
 
 
594 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.65 
 
 
601 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.8 
 
 
594 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.8 
 
 
594 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.57 
 
 
594 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.11 
 
 
607 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.55 
 
 
587 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.47 
 
 
601 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.47 
 
 
601 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.31 
 
 
601 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.32 
 
 
606 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.34 
 
 
594 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  35.08 
 
 
594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.02 
 
 
588 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.54 
 
 
596 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.89 
 
 
587 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.43 
 
 
611 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  36.24 
 
 
589 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.45 
 
 
601 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.23 
 
 
587 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.55 
 
 
587 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.75 
 
 
629 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.29 
 
 
629 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  31.08 
 
 
592 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.84 
 
 
621 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.14 
 
 
586 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.84 
 
 
592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.55 
 
 
618 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.65 
 
 
672 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.43 
 
 
581 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.41 
 
 
592 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.13 
 
 
605 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.5 
 
 
605 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3773  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.2 
 
 
639 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3664  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.91 
 
 
659 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186742  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.08 
 
 
592 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.54 
 
 
612 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.55 
 
 
626 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>