More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2247 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1663  alpha amylase family protein  74.63 
 
 
547 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4896  glycoside hydrolase family 13 protein  85.12 
 
 
736 aa  890    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462682  hitchhiker  0.0000852595 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1466  alpha amylase family protein  74.63 
 
 
547 aa  768    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0286  alpha amylase family protein  74.63 
 
 
547 aa  768    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372704  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2441  putative glycosyl hydrolase  74.63 
 
 
547 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0879  alpha amylase family protein  74.63 
 
 
547 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.592303  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2247  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
551 aa  1103    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0754879 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2577  alpha amylase family protein  74.45 
 
 
547 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0582  alpha amylase family protein  73.35 
 
 
547 aa  754    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3746  glycoside hydrolase family 13 protein  87.25 
 
 
547 aa  913    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260417  normal  0.176524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4515  glycoside hydrolase family protein  92.36 
 
 
550 aa  974    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3678  glycoside hydrolase family 13 protein  92.36 
 
 
550 aa  974    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46883  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5572  glycoside hydrolase family 13 protein  87.07 
 
 
547 aa  916    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13072  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3849  glycoside hydrolase family 13 protein  92.36 
 
 
550 aa  974    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.770452  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0318  alpha amylase family protein  74.63 
 
 
547 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  44.95 
 
 
640 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.95 
 
 
640 aa  337  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.56 
 
 
636 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5594  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.72 
 
 
623 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.774422  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6324  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.05 
 
 
623 aa  299  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602063 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  38.53 
 
 
580 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  38.53 
 
 
580 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  38.53 
 
 
580 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  38.53 
 
 
580 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.87 
 
 
623 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5487  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.73 
 
 
619 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.570083  hitchhiker  0.000688903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.63 
 
 
623 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.63 
 
 
623 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.81 
 
 
598 aa  246  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.17 
 
 
584 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.25 
 
 
634 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7030  glycoside hydrolase family protein  43.62 
 
 
623 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0292632  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.78 
 
 
613 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.78 
 
 
613 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.42 
 
 
634 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.42 
 
 
634 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05186  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase protein  41.98 
 
 
622 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256787  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  33.73 
 
 
600 aa  231  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1823  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.07 
 
 
580 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597034  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0544  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.29 
 
 
572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6343  normal  0.630983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  38.95 
 
 
604 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4051  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.49 
 
 
580 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10082  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1792  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.73 
 
 
580 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.97 
 
 
601 aa  217  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  37.61 
 
 
604 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3650  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.12 
 
 
580 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.736771  normal  0.277493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  36.64 
 
 
592 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.18 
 
 
629 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  37.23 
 
 
583 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.47 
 
 
583 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.13 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  35.55 
 
 
606 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  31.9 
 
 
625 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  37.3 
 
 
618 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.3 
 
 
618 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  34.4 
 
 
615 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.32 
 
 
594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4233  alpha amylase domain-containing protein  33.41 
 
 
687 aa  181  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.49 
 
 
587 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.63 
 
 
604 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.1 
 
 
594 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.1 
 
 
594 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.1 
 
 
594 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6810  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.1 
 
 
605 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368114  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.64 
 
 
594 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.14 
 
 
603 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.9 
 
 
587 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.68 
 
 
607 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.22 
 
 
607 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.78 
 
 
587 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.06 
 
 
611 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.41 
 
 
601 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.41 
 
 
601 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.75 
 
 
601 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.47 
 
 
601 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.47 
 
 
606 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.89 
 
 
588 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.88 
 
 
587 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.3 
 
 
596 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  34.83 
 
 
589 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.16 
 
 
601 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  32.94 
 
 
594 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.46 
 
 
587 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.81 
 
 
592 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  31.81 
 
 
592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.73 
 
 
672 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.75 
 
 
618 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.16 
 
 
621 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.05 
 
 
586 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.49 
 
 
592 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.26 
 
 
581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.53 
 
 
614 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.3 
 
 
629 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.52 
 
 
629 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.79 
 
 
605 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.26 
 
 
626 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  36.74 
 
 
630 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.34 
 
 
600 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.18 
 
 
605 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.93 
 
 
592 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>