More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1609 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0638  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  91.89 
 
 
518 aa  920    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2369  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  92.08 
 
 
518 aa  921    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1609  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
512 aa  999    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4301  ABC transporter related  82.26 
 
 
508 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2963  ABC sugar transporter, ATPase subunit  81.33 
 
 
506 aa  782    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945359  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6919  ABC transporter related  79.8 
 
 
510 aa  779    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173531  normal  0.1656 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0828  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  91.89 
 
 
518 aa  920    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1153  ABC-type sugar transport system, ATPase component  92.28 
 
 
518 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  92.08 
 
 
518 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1792  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  91.89 
 
 
518 aa  920    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8212  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
497 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4923  ABC transporter related  59.68 
 
 
526 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1455  ABC transporter related  56.6 
 
 
548 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.505833  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.41 
 
 
519 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
504 aa  330  5.0000000000000004e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  38.82 
 
 
509 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  40.08 
 
 
516 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
521 aa  312  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36.61 
 
 
503 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  42.56 
 
 
505 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  37.53 
 
 
501 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  37.53 
 
 
501 aa  310  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  36.93 
 
 
501 aa  309  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 
535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  36.98 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  37.19 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
499 aa  306  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  39.64 
 
 
509 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  39.92 
 
 
504 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.69 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.05 
 
 
509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  39.96 
 
 
519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  35.62 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 
516 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  39.18 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  36.81 
 
 
503 aa  302  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  32.99 
 
 
496 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 
498 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  35.76 
 
 
501 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4541  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 
501 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.37 
 
 
508 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  38.52 
 
 
499 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  37.78 
 
 
526 aa  300  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  38.81 
 
 
512 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  34.88 
 
 
501 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3888  ABC transporter related protein  40.36 
 
 
509 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.011244  normal  0.230872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  38.61 
 
 
497 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  36.89 
 
 
501 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 
540 aa  297  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 
508 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
499 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  34.87 
 
 
495 aa  296  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  40.24 
 
 
506 aa  296  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  37.97 
 
 
502 aa  296  8e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  38.41 
 
 
498 aa  296  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  40.73 
 
 
522 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  35.31 
 
 
511 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  36.88 
 
 
508 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 
496 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  36.4 
 
 
504 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  36.44 
 
 
506 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  32.36 
 
 
504 aa  294  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  35.97 
 
 
496 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  35.32 
 
 
501 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  36.95 
 
 
511 aa  294  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 
496 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 
518 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  37.73 
 
 
524 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  35.74 
 
 
506 aa  292  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.29 
 
 
501 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  35.79 
 
 
503 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
501 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  36.29 
 
 
501 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 
523 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  36.29 
 
 
501 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  36.14 
 
 
504 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  36.29 
 
 
501 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  36.29 
 
 
501 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  38.57 
 
 
585 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.08 
 
 
499 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  32.64 
 
 
495 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  35.66 
 
 
500 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  36.05 
 
 
511 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
504 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  38.41 
 
 
499 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  36.08 
 
 
501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  36.08 
 
 
501 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
499 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  36.36 
 
 
492 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  35.09 
 
 
516 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  35.31 
 
 
500 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  35.31 
 
 
499 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  34.46 
 
 
499 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  37.15 
 
 
507 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  38 
 
 
513 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  35.09 
 
 
516 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  35.09 
 
 
516 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.24 
 
 
516 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 
509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>