More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3888 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3888  ABC transporter related protein  100 
 
 
509 aa  980    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.011244  normal  0.230872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2029  ABC transporter related protein  53.83 
 
 
501 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.68 
 
 
499 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 
496 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.87 
 
 
501 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 
501 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  42.8 
 
 
496 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
496 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.17 
 
 
501 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.96 
 
 
501 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
501 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.96 
 
 
501 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  41.96 
 
 
501 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.96 
 
 
501 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  41.34 
 
 
516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.67 
 
 
501 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  41.34 
 
 
501 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  41.34 
 
 
516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  41.34 
 
 
516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.96 
 
 
501 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  42.36 
 
 
501 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.16 
 
 
499 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
497 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.14 
 
 
516 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  41.75 
 
 
501 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.96 
 
 
501 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.07 
 
 
501 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.17 
 
 
503 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.07 
 
 
494 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  39.92 
 
 
504 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.82 
 
 
511 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 
510 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 
515 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
506 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  40.71 
 
 
525 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.38 
 
 
515 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
515 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
515 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  44.18 
 
 
506 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  45.49 
 
 
508 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  39.84 
 
 
494 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  38.84 
 
 
507 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.02 
 
 
517 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
517 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
522 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  43.06 
 
 
501 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.73 
 
 
495 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.54 
 
 
495 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.42 
 
 
516 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.2 
 
 
517 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  44.06 
 
 
495 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.29 
 
 
492 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
511 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
517 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
517 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 
525 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.08 
 
 
519 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.64 
 
 
512 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.54 
 
 
501 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 
519 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.64 
 
 
512 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 
517 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  38.06 
 
 
494 aa  363  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.43 
 
 
512 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.07 
 
 
497 aa  363  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.15 
 
 
514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.15 
 
 
514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.61 
 
 
514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.31 
 
 
497 aa  362  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.52 
 
 
512 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.95 
 
 
506 aa  362  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39 
 
 
501 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  41.24 
 
 
516 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.45 
 
 
496 aa  362  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.59 
 
 
501 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
513 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
517 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.42 
 
 
506 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 
507 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.95 
 
 
514 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.3 
 
 
515 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.37 
 
 
506 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.74 
 
 
524 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.89 
 
 
513 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.4 
 
 
500 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.39 
 
 
507 aa  360  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  36.85 
 
 
501 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.94 
 
 
520 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  43.78 
 
 
506 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  43.28 
 
 
517 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.85 
 
 
501 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  44.73 
 
 
519 aa  359  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.71 
 
 
513 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.1 
 
 
521 aa  359  7e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  43.78 
 
 
528 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  40.84 
 
 
500 aa  359  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.95 
 
 
524 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.95 
 
 
524 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  43.98 
 
 
517 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>