More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4301 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4301  ABC transporter related  100 
 
 		 508 aa  1018    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0638  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  79.16 
 
 		 518 aa  781    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2369  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  79.56 
 
 		 518 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1609  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  82.26 
 
 		 512 aa  816    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6919  ABC transporter related  88.02 
 
 		 510 aa  874    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173531  normal  0.1656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2963  ABC sugar transporter, ATPase subunit  88.53 
 
 		 506 aa  872    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945359  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0828  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  79.16 
 
 		 518 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1153  ABC-type sugar transport system, ATPase component  79.56 
 
 		 518 aa  786    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  79.36 
 
 		 518 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1792  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  79.16 
 
 		 518 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8212  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.34 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4923  ABC transporter related  56.02 
 
 		 526 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1455  ABC transporter related  54.38 
 
 		 548 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.505833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.68 
 
 		 519 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  39.12 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  36.71 
 
 		 501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.38 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  35.98 
 
 		 501 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  38.9 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  35.43 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36.51 
 
 		 503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  37.3 
 
 		 535 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.96 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 505 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  39.75 
 
 		 516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  36.23 
 
 		 501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  35.68 
 
 		 501 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  35.28 
 
 		 508 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 		 511 aa  302  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  36.36 
 
 		 500 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  35.79 
 
 		 504 aa  300  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  37.37 
 
 		 504 aa  299  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  40.08 
 
 		 509 aa  299  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  34.44 
 
 		 501 aa  299  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 		 496 aa  299  9e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  35.74 
 
 		 501 aa  299  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.69 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  34.32 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  37.37 
 
 		 509 aa  299  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  35.61 
 
 		 501 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 		 516 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  37.26 
 
 		 497 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  35.4 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  35.4 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  37.01 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  35.4 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 497 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  35.4 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  35.76 
 
 		 508 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  35.44 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.59 
 
 		 508 aa  296  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  35.56 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  35.16 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 494 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  37.78 
 
 		 521 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  38.95 
 
 		 511 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.45 
 
 		 506 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  37.63 
 
 		 524 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  34.78 
 
 		 499 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0455  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.06 
 
 		 493 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.3 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  34.3 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.9 
 
 		 518 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  34.3 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  34.3 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  34.3 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1814  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 493 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  34.3 
 
 		 501 aa  291  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0812  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 505 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1103  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 493 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 493 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  35.4 
 
 		 503 aa  291  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  34.95 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  35.01 
 
 		 496 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  34.56 
 
 		 511 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  38.48 
 
 		 499 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0360  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.85 
 
 		 493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  35.49 
 
 		 500 aa  289  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  37.79 
 
 		 510 aa  289  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  34.07 
 
 		 506 aa  289  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  34.09 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 492 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  34.09 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  33.12 
 
 		 495 aa  289  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  33.81 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  33.81 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  37.32 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  33.81 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  34.33 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  36.1 
 
 		 502 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  33.54 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  36.95 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  33.81 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  36.7 
 
 		 861 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>