More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4923 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4923  ABC transporter related  100 
 
 		 526 aa  1044    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8212  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.16 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6919  ABC transporter related  57.65 
 
 		 510 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173531  normal  0.1656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1609  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.57 
 
 		 512 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2963  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.95 
 
 		 506 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945359  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1153  ABC-type sugar transport system, ATPase component  59.22 
 
 		 518 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0638  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.63 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2369  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.82 
 
 		 518 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0828  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1792  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1455  ABC transporter related  58.46 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.505833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4301  ABC transporter related  55.75 
 
 		 508 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  40.85 
 
 		 585 aa  347  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  35.48 
 
 		 503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 510 aa  326  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  36.05 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.26 
 
 		 496 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 508 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  39.03 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.08 
 
 		 519 aa  317  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  38.54 
 
 		 504 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  38.54 
 
 		 509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.53 
 
 		 499 aa  313  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  38.66 
 
 		 511 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 499 aa  312  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  37.32 
 
 		 544 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  37.68 
 
 		 507 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 505 aa  309  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  40.04 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  33.13 
 
 		 499 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  38.02 
 
 		 519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  37.68 
 
 		 507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  35.66 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.73 
 
 		 512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  35.86 
 
 		 506 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  33.27 
 
 		 494 aa  307  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  34.54 
 
 		 500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  38.74 
 
 		 503 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  32.67 
 
 		 510 aa  306  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  38.59 
 
 		 516 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  34.02 
 
 		 495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  37.1 
 
 		 510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  38.03 
 
 		 522 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  39.88 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  38.04 
 
 		 526 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  35.94 
 
 		 544 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  37.45 
 
 		 509 aa  301  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  38.03 
 
 		 493 aa  300  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 496 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 521 aa  300  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  37.1 
 
 		 524 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 		 516 aa  299  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  37.35 
 
 		 499 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  37.14 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  40.13 
 
 		 505 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  37.07 
 
 		 504 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  36.14 
 
 		 502 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  37.07 
 
 		 504 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  37.07 
 
 		 504 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  34.76 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  35.64 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  34.12 
 
 		 504 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.58 
 
 		 514 aa  294  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  34.01 
 
 		 508 aa  294  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  36.85 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  34.58 
 
 		 523 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.36 
 
 		 516 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  34.02 
 
 		 499 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  32.45 
 
 		 494 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  34.58 
 
 		 499 aa  293  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  36.31 
 
 		 505 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  36.27 
 
 		 501 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  34.58 
 
 		 500 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  34.58 
 
 		 499 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  36.63 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  36.63 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35.76 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  35.89 
 
 		 861 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  35.74 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  34.78 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 496 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  35.56 
 
 		 496 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.81 
 
 		 503 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  34.58 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  39.02 
 
 		 522 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  34.08 
 
 		 525 aa  290  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  37.93 
 
 		 504 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  35.9 
 
 		 537 aa  289  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  37.93 
 
 		 504 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  37.2 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  35.59 
 
 		 501 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  36.14 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  37.68 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  37.72 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.87 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>