More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1455 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1455  ABC transporter related  100 
 
 		 548 aa  1093    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.505833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8212  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1609  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.6 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2369  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.82 
 
 		 518 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.82 
 
 		 518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0638  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.62 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0828  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.62 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1153  ABC-type sugar transport system, ATPase component  55.82 
 
 		 518 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1792  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.62 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6919  ABC transporter related  55.44 
 
 		 510 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173531  normal  0.1656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4301  ABC transporter related  54.38 
 
 		 508 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2963  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.75 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945359  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4923  ABC transporter related  57.68 
 
 		 526 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  40 
 
 		 516 aa  317  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.05 
 
 		 508 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.4 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  35.14 
 
 		 499 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.63 
 
 		 516 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  37.72 
 
 		 509 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  38.97 
 
 		 511 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  39.29 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  38.4 
 
 		 585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  39.29 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  36.36 
 
 		 861 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  38.69 
 
 		 499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  39.28 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  35.64 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  35.83 
 
 		 523 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  38.97 
 
 		 504 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  38.97 
 
 		 504 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  35.57 
 
 		 504 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.11 
 
 		 516 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  37.73 
 
 		 511 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  38.98 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  38.72 
 
 		 504 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 521 aa  300  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  38.05 
 
 		 519 aa  300  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  36.47 
 
 		 502 aa  300  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  37.08 
 
 		 511 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  38.32 
 
 		 524 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  37.81 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  37.71 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  36.79 
 
 		 510 aa  296  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 		 503 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 		 499 aa  296  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0887  ABC transporter related  38.35 
 
 		 497 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  34.87 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  33.27 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  35.69 
 
 		 501 aa  295  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36 
 
 		 503 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  38.29 
 
 		 522 aa  294  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 505 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  34.17 
 
 		 495 aa  293  7e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  34.89 
 
 		 500 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  37.42 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  39.92 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  35.49 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  30.77 
 
 		 496 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  31.65 
 
 		 501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  32.34 
 
 		 510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  34.52 
 
 		 501 aa  290  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 501 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  37.01 
 
 		 499 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  34.87 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  35.13 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  35.96 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  36.33 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  34.91 
 
 		 499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 494 aa  287  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  36.29 
 
 		 503 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  35.42 
 
 		 501 aa  286  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  35.28 
 
 		 505 aa  286  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 504 aa  286  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  37.15 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  36.27 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  37.34 
 
 		 502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  36.27 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  35.34 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  36.17 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.42 
 
 		 515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  34.18 
 
 		 506 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  37.03 
 
 		 508 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4541  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  35.28 
 
 		 509 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  37.15 
 
 		 499 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.18 
 
 		 506 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  34.18 
 
 		 506 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  36.56 
 
 		 511 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3329  ABC transporter related  35.25 
 
 		 527 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  35.11 
 
 		 501 aa  283  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  33.33 
 
 		 512 aa  282  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  36.51 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  38.33 
 
 		 502 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>