More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2963 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0638  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  78.64 
 
 		 518 aa  775    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2369  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  79.04 
 
 		 518 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1609  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  81.33 
 
 		 512 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2963  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 506 aa  1014    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945359  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0828  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  78.64 
 
 		 518 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4301  ABC transporter related  88.53 
 
 		 508 aa  894    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1153  ABC-type sugar transport system, ATPase component  79.04 
 
 		 518 aa  778    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  78.84 
 
 		 518 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1792  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  78.64 
 
 		 518 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6919  ABC transporter related  95.06 
 
 		 510 aa  954    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173531  normal  0.1656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8212  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4923  ABC transporter related  57 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1455  ABC transporter related  54.75 
 
 		 548 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.505833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 504 aa  329  7e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  40.45 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.83 
 
 		 519 aa  320  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  35.98 
 
 		 495 aa  317  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  38.26 
 
 		 504 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  37.8 
 
 		 509 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.92 
 
 		 499 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  37.66 
 
 		 509 aa  312  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  35.98 
 
 		 501 aa  312  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.43 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  38.83 
 
 		 509 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  36.18 
 
 		 501 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.51 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  38.98 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  36.76 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  36.51 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  37.35 
 
 		 535 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.89 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  32.57 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  36.23 
 
 		 501 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  36.57 
 
 		 511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  36.13 
 
 		 499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  36.7 
 
 		 500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  36.34 
 
 		 499 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39.26 
 
 		 501 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  36.96 
 
 		 501 aa  303  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 499 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  35.39 
 
 		 501 aa  303  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  38.95 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  34.99 
 
 		 503 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  36.29 
 
 		 497 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  35.48 
 
 		 501 aa  300  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  34.22 
 
 		 501 aa  300  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.83 
 
 		 498 aa  299  9e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  37.34 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  34.24 
 
 		 508 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  39.26 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  35.08 
 
 		 500 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  35.08 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  35.08 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  38.43 
 
 		 505 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.34 
 
 		 499 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  36.29 
 
 		 508 aa  297  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  37.32 
 
 		 506 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  37.76 
 
 		 524 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  34.72 
 
 		 496 aa  295  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  38.11 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  35.94 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  34.51 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 		 540 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  34.92 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  37.6 
 
 		 861 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  36.06 
 
 		 501 aa  294  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  36.06 
 
 		 501 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  35.67 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  35.91 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.06 
 
 		 501 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  37.99 
 
 		 502 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  36.08 
 
 		 511 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  36.06 
 
 		 501 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  36.06 
 
 		 501 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 521 aa  292  7e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  36.06 
 
 		 501 aa  293  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  37.6 
 
 		 585 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 		 494 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  36.08 
 
 		 506 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  35.85 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  35.85 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  35.27 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  33.68 
 
 		 495 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  37.01 
 
 		 513 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  36.65 
 
 		 493 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.46 
 
 		 512 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.55 
 
 		 512 aa  290  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 510 aa  289  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 		 496 aa  289  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  32.16 
 
 		 502 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  32.78 
 
 		 498 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  35.74 
 
 		 508 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  36.8 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.74 
 
 		 503 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  35.02 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>