117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0604 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  925    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  60.39 
 
 		 512 aa  581  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  44.69 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  44.9 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  42.05 
 
 		 538 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  39.54 
 
 		 506 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  39.01 
 
 		 507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  39.96 
 
 		 517 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  39.87 
 
 		 476 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  39.15 
 
 		 515 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  38.88 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  36.92 
 
 		 495 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  34.8 
 
 		 491 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  37.14 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  36.46 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  31.56 
 
 		 499 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  34.11 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  32.67 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  32.67 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  32.66 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  31.17 
 
 		 499 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  29.68 
 
 		 496 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  27.44 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  25.38 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  25.58 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  23.35 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  24.48 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  27.11 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  25.39 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  23.5 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  24.09 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  23.79 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  22.66 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  23.85 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  22.66 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  23.32 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  22.54 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  24.46 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  26.99 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  24.42 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  24.25 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  24.25 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  24.78 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  24.25 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  23.38 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  23.36 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  21.76 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  23.85 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  24.55 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  24.58 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  24.78 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  23 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  22.75 
 
 		 798 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  23.48 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  23.57 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  24.17 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  24.24 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  23.27 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  23.36 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  23.7 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  23.56 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  24.69 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  23.08 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  24.23 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  23.13 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  23.18 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  23.85 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  26.61 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  23.1 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  21.91 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  23.03 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  22.85 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  24.71 
 
 		 484 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  35.71 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  34.65 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  31.43 
 
 		 222 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  24.56 
 
 		 488 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  29.75 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  25.28 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  30.94 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  23.94 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  23.69 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  26.67 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  37.08 
 
 		 336 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  21.64 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  32.73 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  23.72 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  25.57 
 
 		 478 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  30 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  22.7 
 
 		 475 aa  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  29.61 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  26.8 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  24.91 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  35 
 
 		 345 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  24.91 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  24.91 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  32.52 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  23.55 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>