136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4623 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  100 
 
 
482 aa  980    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  50.41 
 
 
482 aa  448  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  49.28 
 
 
482 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  47.29 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  43.43 
 
 
445 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  41.51 
 
 
476 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  45.59 
 
 
478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  44.22 
 
 
459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  41.82 
 
 
488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  41.8 
 
 
445 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  40.58 
 
 
470 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  41.34 
 
 
490 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  39.54 
 
 
472 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  40.94 
 
 
436 aa  323  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  41.33 
 
 
476 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  40.2 
 
 
473 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  37.19 
 
 
462 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  35.23 
 
 
471 aa  243  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  37.84 
 
 
488 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  34.16 
 
 
798 aa  236  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  34.13 
 
 
470 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  32.39 
 
 
481 aa  224  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  31.09 
 
 
473 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  34.5 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  34.22 
 
 
479 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  32.78 
 
 
542 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  31.64 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  35.37 
 
 
479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  32.91 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  32.31 
 
 
492 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  31.47 
 
 
493 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  34.87 
 
 
480 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  33.4 
 
 
479 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  33.33 
 
 
479 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  33.33 
 
 
479 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  32.01 
 
 
487 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  32.16 
 
 
491 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  30.4 
 
 
469 aa  196  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  31.64 
 
 
470 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  30.3 
 
 
512 aa  193  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  33.71 
 
 
465 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  32.81 
 
 
472 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  31.01 
 
 
488 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  31.96 
 
 
435 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  32.74 
 
 
464 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  30.27 
 
 
467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  31.21 
 
 
485 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  29.2 
 
 
484 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  28.67 
 
 
462 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  27.73 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  30.38 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  27.99 
 
 
474 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  29.71 
 
 
473 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  29.49 
 
 
473 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  29.49 
 
 
473 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  29.49 
 
 
473 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  29.49 
 
 
473 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  31.63 
 
 
447 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  29.49 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  29.49 
 
 
432 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  29.67 
 
 
478 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  29.67 
 
 
478 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  29.67 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.01 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  28.92 
 
 
479 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  30.65 
 
 
432 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  27.86 
 
 
465 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.67 
 
 
438 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  29.24 
 
 
465 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  28.7 
 
 
479 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.59 
 
 
442 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  28.77 
 
 
436 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  31.15 
 
 
445 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  29 
 
 
484 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.16 
 
 
421 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.51 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  27.77 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  29.96 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  27.99 
 
 
488 aa  146  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  29.03 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  28.74 
 
 
423 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  27.39 
 
 
482 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  27.09 
 
 
482 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  25.94 
 
 
452 aa  116  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  42.68 
 
 
200 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  24.9 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  28.24 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  36.95 
 
 
222 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  27.32 
 
 
449 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  25.22 
 
 
431 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  25.39 
 
 
431 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  24.72 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  26.65 
 
 
491 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  26.34 
 
 
451 aa  96.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  41.8 
 
 
196 aa  90.1  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  25.42 
 
 
445 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  27.45 
 
 
480 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  27.45 
 
 
480 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  26.46 
 
 
512 aa  87.8  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  24.94 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>