106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2624 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 
459 aa  941    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  43.35 
 
 
482 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  57.49 
 
 
291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  28.82 
 
 
482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  28.22 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  26.67 
 
 
482 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  27.61 
 
 
462 aa  106  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  24.81 
 
 
445 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  28.46 
 
 
436 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  25.37 
 
 
490 aa  97.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  25.74 
 
 
472 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  27.95 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  28.38 
 
 
477 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  38.03 
 
 
464 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  27.75 
 
 
480 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  26.09 
 
 
476 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  25.73 
 
 
481 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  25.61 
 
 
473 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  26.06 
 
 
488 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  25 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  26.8 
 
 
421 aa  87.4  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  24.34 
 
 
467 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  23.57 
 
 
462 aa  87  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  24.75 
 
 
480 aa  86.7  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  25.18 
 
 
480 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.57 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  24.94 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  25 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  26.53 
 
 
442 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  25.12 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  25.12 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  25.12 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  25.12 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  28.64 
 
 
480 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  25.36 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  26.01 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  28.65 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  27.75 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  28.93 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  25 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  25 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  25 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  33.8 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  25.26 
 
 
798 aa  80.9  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  36.76 
 
 
482 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  32.08 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  34.93 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  33.96 
 
 
200 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  25 
 
 
445 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  27.66 
 
 
512 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  29.13 
 
 
488 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  36.49 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  28.82 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  27.51 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  21.71 
 
 
492 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  26.23 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  25 
 
 
484 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  29.7 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  27.25 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  27.25 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  27.2 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  26.23 
 
 
475 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  35.04 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  32.08 
 
 
456 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  25.58 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  25.84 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  25.84 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  25.84 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  25.58 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  35.21 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  25.62 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  32.56 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  34.21 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  25.82 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  35.66 
 
 
438 aa  67  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  33.1 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  25.26 
 
 
470 aa  67  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  33.56 
 
 
452 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  24.81 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  33.14 
 
 
222 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  25.4 
 
 
491 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  25.76 
 
 
473 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  35.65 
 
 
499 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  28.8 
 
 
465 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  24.71 
 
 
427 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  23.66 
 
 
472 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  25.88 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  26.99 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  27.59 
 
 
470 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  32.17 
 
 
431 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  31.19 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  31.93 
 
 
479 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  30.95 
 
 
467 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  31.76 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  24.1 
 
 
495 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  23.56 
 
 
496 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  38.3 
 
 
192 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  36.36 
 
 
511 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  28.82 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  23.51 
 
 
480 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>