142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4566 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  69.98 
 
 		 472 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  962    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  54.55 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  47.84 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  46.4 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  46.53 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  44.42 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  46.44 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  45.83 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  44.57 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  41.37 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  42.65 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  42.79 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  43.58 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  46 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  40.58 
 
 		 482 aa  340  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  45.18 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  37.62 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  36.05 
 
 		 487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  37.02 
 
 		 491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  37.96 
 
 		 479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  34.85 
 
 		 473 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  38.38 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  39.95 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  38.7 
 
 		 478 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  38.7 
 
 		 478 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  38.7 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  37.66 
 
 		 472 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  37.58 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  37.24 
 
 		 465 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  38.57 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  39.09 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  38.86 
 
 		 432 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  38.64 
 
 		 473 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  38.64 
 
 		 473 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  38.64 
 
 		 473 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  38.64 
 
 		 473 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  38.34 
 
 		 484 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  35.31 
 
 		 493 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  34.08 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  33.74 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  33.99 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  32.91 
 
 		 467 aa  236  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  36.3 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  36.6 
 
 		 442 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  32.63 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  35.14 
 
 		 488 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  35.12 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  35.45 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  32.09 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  35.45 
 
 		 481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  32.35 
 
 		 798 aa  220  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  33.58 
 
 		 474 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  36.95 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  33.11 
 
 		 485 aa  213  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  33.25 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  32.98 
 
 		 479 aa  209  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  33.06 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  33.97 
 
 		 482 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  32.86 
 
 		 479 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  31.11 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  32.99 
 
 		 479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  32.99 
 
 		 479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  35.82 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  30.17 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  29.82 
 
 		 488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  30 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  29.85 
 
 		 465 aa  196  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  30.62 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  33.4 
 
 		 479 aa  193  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  31.14 
 
 		 465 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  30.22 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  29.93 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  32.85 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  34.47 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  31.02 
 
 		 488 aa  180  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  30.79 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.95 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  31.59 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  30.77 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  27.78 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  41.01 
 
 		 200 aa  136  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  26.79 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  27.09 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  26.61 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  27.19 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  29.02 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  30.93 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  26.74 
 
 		 451 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  25.93 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  26.65 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  28.22 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  40.51 
 
 		 222 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  37.43 
 
 		 196 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  24.21 
 
 		 480 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  24.21 
 
 		 480 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  25.31 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  35.29 
 
 		 191 aa  91.3  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>